[求救] Real time PCR測試primer有問題!

看板Biotech (生命科學)作者 (sylvia)時間13年前 (2012/08/11 12:28), 編輯推噓0(004)
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最近第一次使用real time pcr test cdna 測試樣本前老闆要我先測試primer 就是以不同稀釋倍數(1/1,1/4,1/16...1/1024)的sample來看ct是否差2個cycle 結果出來,3重複間有的會差到兩個cycle,然後各稀釋濃度間的slope也不是2 (很多大於2) 老闆跟我說有可能是: 1.pipet有誤差 2.cdna裡面的inhibitor讓最高的濃度那管比較難p,所以slope才會大於2 建議我cdna先purify後再分裝成不同濃度再test 想請問大家除了這兩個原因之外還有什麼我應該要注意的? 第一次使用好多地方不是很懂 還有在pipetting上應該要注意的地方? 我是用abi 7300機器,kapa的sybr,都是先mix在別管裡面(這裡pipet應該沒問題吧?) 再一次將3重複加到96孔盤 希望大家給我一些意見,謝謝!!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 118.166.192.41

08/12 21:34, , 1F
Mixture加之前要vortex,這樣三重複就會比較一致
08/12 21:34, 1F

08/12 22:41, , 2F
mix配需要使用量的1.1~1.2倍 避免pipetting lose讓最後
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一管不足
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感謝樓上!後來我自己發現應該是template濃度太低
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文章代碼(AID): #1G9Tz-SQ (Biotech)
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