[求救] 如何從引子序列反推標的物序列

看板Biotech (生命科學)作者 (meimei)時間13年前 (2012/11/16 23:05), 編輯推噓2(203)
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這個標題不曉得這樣下適不適合... 問題是這樣: 手上有兩對引子 都是以前實驗室學姐訂購的 引子的資訊已經不復存在 只剩引子管身上寫明基因名稱(但其中一管字跡也模糊難辨)Tm值 及引子序列 現在要使用 我想要確定這引子是會合成出什麼基因的片段 還有長度是多少(此引子是for RT-PCR 所以應該是跨exon) 我自己是想過 看的出基因名稱的 直接網路上搜尋此基因序列 利用網路軟體找出引子 再跟 手上的引子比看看 不知道基因名稱的 是否可以直接把序列作比對 看會對到什麼基因 這樣 目前只想到這樣 可是試過好像不ok.... 想問問大家 有沒有類似經驗或是什麼建議的 謝謝了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 125.224.9.157

11/16 23:11, , 1F
blast就可以了
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11/16 23:11, , 2F
進blast網站,把primer打進去,看夾出什麼基因就可以
11/16 23:11, 2F

11/16 23:22, , 3F
可以用NCBI的primer blast, 兩條打進去 他會告訴你夾到什麼
11/16 23:22, 3F

11/16 23:23, , 4F
還有大小, 但要注意選的是cDNA or whole genome
11/16 23:23, 4F

11/19 22:08, , 5F
我再試試看囉 謝謝
11/19 22:08, 5F
文章代碼(AID): #1GfbP06U (Biotech)
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