[求救] IP總是出現non-specific band

看板Biotech (生命科學)作者 (ilovesuju)時間12年前 (2013/06/07 23:31), 編輯推噓3(3011)
留言14則, 4人參與, 最新討論串1/1
各位板友好, 我的實驗是想透過IP研究蛋白質A和N在腦瘤細胞中是否有直接的interaction。 我將V5-A和Flag-N的plasmid,同時transfect到細胞中,之後就可以利用V5或是Flag抗體 來pull down (control組用mIgG)。跑完WB之後,用V5與Flag抗體來偵測所抓下來的蛋白 質。 可是我現在遇到一個問題了。在我的IgG組,總是會偵測到一個non-specific band, 而 且這個band的位置,正好與Flag-N的大小幾乎一樣(大約110kD)。 為什麼我會知道那是non-specific band,而不是Flag-N。因為我之前做了一個簡單的測 試,我只transfect V5-A (沒有Flag-N),然後用IgG與V5抗體去pull down。之後我將跑 完的膠,還是用Flag抗體來hybridize,結果在同樣的位置也出現這條band。 我附上我做的測試實驗,這樣子應該會更清楚。 http://www.wretch.cc/album/show.php?i=hahaha93&b=1&f=1050765560&p=0 希望如果有對IP很有經驗的版友們,可以給我一些建議, 或是有人願意跟我討論實驗就太好了,多謝大家了。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 141.50.39.150

06/07 23:51, , 1F
不能換別種species的Ab再做一次IP嘛?!
06/07 23:51, 1F

06/08 00:01, , 2F
我會想把WB的Flag換一下,因為看起來不是IP的問題
06/08 00:01, 2F

06/08 23:54, , 3F
這是二抗的問題 會認到IP用的抗體
06/08 23:54, 3F

06/08 23:55, , 4F
理想上IP的抗體用的物種跟WB用的不一樣最乾淨
06/08 23:55, 4F

06/08 23:59, , 5F
換tag一樣要避開物種 不然有極大可能會有一樣的問題
06/08 23:59, 5F

06/09 02:10, , 6F
如果是二抗問題,mouse二抗並沒有認到mFlag喔,除非曝光不夠
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06/09 02:17, , 7F
我說的換Flag當然是換別物種或換支Ab clone,而非換其他tag
06/09 02:17, 7F

06/09 04:12, , 8F
謝謝各位,所以我如果用別物種的anti-flag Ab for WB
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06/09 04:15, , 9F
應該可以避免二抗結合到IP用的抗體上囉
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06/09 04:19, , 10F
blence大說的也很有道理,但在我別次的IP實驗中,
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06/09 04:21, , 11F
當我用Flag Ab IP時,比較沒有這個問題,但IgG組一直都有
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06/09 04:22, , 12F
non-specific band的產生
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06/09 17:51, , 13F
不同支抗體可能會有不一樣的band出來 很難講呢
06/09 17:51, 13F

06/09 17:52, , 14F
換WB的抗體問題應該可以解決
06/09 17:52, 14F
文章代碼(AID): #1HiVpSlU (Biotech)
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