[求救] 收protein濃度很低

看板Biotech (生命科學)作者 (水球是甚麼 能吃嗎)時間12年前 (2013/11/06 11:03), 編輯推噓5(5012)
留言17則, 10人參與, 最新討論串1/1
如題 protein抽出來濃度極低阿 濃度都是1ug/ul 上下遊走 loading量真的很大 >"< 但是沒有錢買任何濃縮的kit ,所以只能想辦法改善問題 首先實驗室現在用RIPA lysis buffer with 0.1%SDS 但是之前沒有SDS 抽出來的protein量就比較多 還是是SDS影響? 還有大家都如何抽出高濃度的protein? 再來lab實驗步驟是 6cm dish 的細胞 PBS wash後吸乾 直接加100ul lysis buffer刮下來 然後放置4℃ 於旋轉盤上轉15min 之後離心取液體部分 但有些問題就是加了有些特定藥物離心的pellet會呈現黏稠狀 (但是我收之前觀察細胞沒死還滿滿的,MTT assy 也跟control組差不多) 像這樣黏稠的pellet 通常刮細胞時有就呈現鼻涕樣的黏稠狀 這樣又是為甚麼? 希望大家幫我解答 謝謝了 :) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.123.85.162

11/06 11:36, , 1F
多做一步sonication 你會發現另一片天
11/06 11:36, 1F
所以是刮下來後sonication再去轉

11/06 12:35, , 2F
60mm dish加100ul,會不會覺得收下來的體積增減的變化很大?
11/06 12:35, 2F
我也是有多加過但是濃度一樣低

11/06 15:57, , 3F
有加protease和phosphotase inhibitor嗎?
11/06 15:57, 3F

11/06 16:51, , 4F
6cm加100....
11/06 16:51, 4F

11/06 16:56, , 5F
6cm加100有覆蓋整個底盤嗎?還有inhibitor很重要
11/06 16:56, 5F
請問你們6cm都加多少呢?

11/06 23:36, , 6F
大概是新的lysis buffer更強大了,讓DNA都跑出來,如一樓所說
11/06 23:36, 6F

11/06 23:36, , 7F
多做一步sonication就行了。
11/06 23:36, 7F
但是DNA跑出來都只限於我加了藥後的細胞,而且其他人沒DNA跑出來這困擾

11/07 07:53, , 8F
6公分只加100太少了吧,再多加100~150吧!
11/07 07:53, 8F
好低 :)

11/07 07:55, , 9F
實驗室沒人帶你實驗嗎?這你的問題很基礎欸
11/07 07:55, 9F
我知道是黏稠是DNA,但是因為同時間收的都只有加了藥的sample才這樣,所以才想 問一下看看是否有其他見解, 至於加100ul 是我們lab歷屆來學長姐都這樣做也是 沒問題,以前用沒有SDS的lysis buffer濃度也不錯

11/07 11:44, , 10F
其實我6cm都只加70ul...Orz,lysis buffer還自己泡
11/07 11:44, 10F
跟我們家一樣甚麼都自己泡,窮實驗室只能這樣,那你加70ul 濃度還可以嗎? ※ 編輯: mango1986 來自: 140.123.85.162 (11/07 14:16)

11/07 14:36, , 11F
SDS會影響濃度測定,跟你用的assay有關,6cm用100ul在我用的
11/07 14:36, 11F

11/07 14:38, , 12F
十幾種human lines,多是刮下來用這個量,何況你是直加plate
11/07 14:38, 12F

11/07 14:41, , 13F
藥物的部分,MTT是outcome,無法連結藥物是否影響DNA extract
11/07 14:41, 13F

11/07 14:44, , 14F
如果步驟只是有沒加SDS的差別,我那會猜你是用的定量方法
11/07 14:44, 14F

11/13 12:15, , 15F
我很好奇你用甚麼方法定量
11/13 12:15, 15F

11/25 07:10, , 16F
我覺得你SDS加不只0.1%吧
11/25 07:10, 16F

11/25 07:13, , 17F
太多SDS DNA會沉澱不好(如果ChIP有用福馬林固定就不會 XD)
11/25 07:13, 17F
文章代碼(AID): #1IUR68uG (Biotech)
文章代碼(AID): #1IUR68uG (Biotech)