[求救] Real-time PCR positive control無訊號

看板Biotech (生命科學)作者 (無心)時間12年前 (2014/01/14 14:10), 編輯推噓2(2015)
留言17則, 5人參與, 最新討論串1/1
各位前輩好: 自從接觸Real time PCR後結果一直很不穩定, 想請問前輩們是否也有相關經驗 可以稍微提點一下 原本我只是負責幫忙出"手"趕data的人... 師父先找好條件後,由我和另一位前輩負責將樣品做完 我們用的是ABI7000的機台,enzyme選用Roche fast hot start Taq enzyme 一開始先捉internal control之條件 師父告知annealing 溫度為72度 故反應條件則為 94度2分鐘, 1cycle 94度5分鐘, 1cycle 接下來40cycle則是 94度30秒, 72度1分鐘 total reaction volume 20ul, Taq enzyme0.3ul Ct值要嘛沒有不然就是38-40cycle才出來 後來師父重新捉條件後,叫我把Taq enzyme改取1ul.... 測試一次正常後就開始找target gene的條件了 最近重新回來做internal control之qPCR 師父說,他重新訂了primer(和原本序列一樣), annealing溫度要改成64度 40cycle之條件改為 94度30秒 64度30秒 72度30秒 (hot start和上面一樣) 我就像鬼打牆一樣...positive control怎麼做都做不出來 和我一起執行的前輩有做出來...但她的NTC也有訊號 我試過很多次, 也試過前輩用的primer , buffer 其中也有陸陸續續換過SYBR, Buffer, dNTP, primer, templete 怎麼做都沒有訊號 不知大家有什麼建議...可以提供做為參考 PS: 酒精噴太多會造成干擾qPCR的結果嗎?? 雖然現在噴完都會等一下才開始執行開蓋的動作 但實在想不出還有什麼會影響實驗結果的東西了 還有一個問題...照理qPCR條件捉好後是否還是會變來變去啊?? 如果會...那要怎麼做半定量?? 如果不會....那會變來變去可能的原因是什麼呢? 煩請大家協助解惑 感恩 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.96.146.51

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Annealing溫度 建議先跑gradient PCR, 以結果決定最佳溫度
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01/14 16:49, , 2F
意思是說原本OK的annealing溫度跑掉也是正常的囉??
01/14 16:49, 2F

01/14 22:42, , 3F
為何條件變來變去應該去問你前輩 是他改的, 正常來講同樣序列
01/14 22:42, 3F

01/14 22:42, , 4F
的引子重新合條件也不會變, 何況變這麼多根本不合理
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01/14 23:53, , 5F
是全部都沒訊號還是只有PC沒訊號? 用的tube蓋子是可透光的吧?
01/14 23:53, 5F

01/15 09:01, , 6F
前輩說條件跑掉了..以前做得出來..但現在同條件就不OK
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01/15 09:02, , 7F
現在前輩歸究在primer合成後沒有要要HPLC check等級
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01/15 09:03, , 8F
這方面我是不懂...但每次合回來Primer確實都有變數
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01/15 09:04, , 9F
目前是全部沒訊號..但管子和蓋子是之前測試過的
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01/15 09:04, , 10F
曾經做過有訊號的管子及蓋子
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01/16 00:25, , 11F
就近實驗室找個會realtime pcr的人問問看,閱讀試劑說明書,把
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01/16 00:26, , 12F
原理搞清楚,才不會越做越無力,耗費時間和金錢。
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01/16 09:06, , 13F
一直都有在問人...只是師父決定的東西是不大能撼動的..
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理論上捉好條件應該可以一直重覆..光這點就是鬼打牆
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師父也只是回我...不知道...反正原本條件就做不出來..要換
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01/25 03:34, , 16F
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01/25 03:34, , 17F
看第6頁 primer annealing 溫度的建議
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文章代碼(AID): #1IrDJKuM (Biotech)
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