[討論] Lentiviral over-expression titer 問題

看板Biotech (生命科學)作者 (阿手)時間11年前 (2014/01/23 22:09), 編輯推噓5(5013)
留言18則, 5人參與, 最新討論串1/1
實驗室一直以來都使用 RNAi core 的pAS3W vector , 但是常常做出來的cDNA over-expression lentivirus的 titer都很差, 相較於做shRNA knockdown的lentivirus, titer會降低超過十倍以上。 (有看過之前的討論串說 pAS3W 生產出來的 virus titer 好像效果不佳) 想請問各位前輩會有 做cDNA over expression的lentivirus, 但titer很差的問題嗎? 另外, 想再請問各位板上的前輩 習慣使用哪種over-expression vector來生產lentivirus 且效果(titer)又不錯的? 感謝各位的經驗分享與指教, 謝謝大家。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.55.238 ※ 編輯: bcher 來自: 140.109.55.238 (01/23 22:12) ※ 編輯: bcher 來自: 140.109.55.238 (01/23 22:13)

01/24 00:21, , 1F
AS的RNAi core說:不要拿shRNA跟cDNA的比較啦
01/24 00:21, 1F

01/24 00:23, , 2F
我用pLKO-shRNA跟pLX301-cDNA做的,也是差很大
01/24 00:23, 2F

01/24 04:16, , 3F
因為你塞進去的cDNA跟shRNA的size差很多
01/24 04:16, 3F

01/24 04:17, , 4F
而vector的大小會影響lentiviral package的效率
01/24 04:17, 4F

01/24 11:15, , 5F
open biosystems的pCDH,或是流通已久的pHR or pHR'都不差
01/24 11:15, 5F
回應各位前輩: 是的是的, 我們似乎也是有 cDNA長度與titer成反比 的現象, 塞進去的cDNA越長(約1500bps 或2000bps以上), titer就超級低 但如果cDNA長度大約在1000bps以下,甚至是500~600bps之間, 生產出來的virus titer就好很多。 如果各位前輩有 推薦 或 曾經使用過的 lentiviral over-expression vector 且 塞進1500bps至2000bps左右的cDNA後, virus titer 都還不錯的話, 我都願意盡力去買來試看看。 ※ 編輯: bcher 來自: 140.109.55.238 (01/24 15:12)

01/24 23:48, , 6F
不然就是用濃縮法,高速離心或是市售的column
01/24 23:48, 6F

01/25 00:06, , 7F
NaCl/PEG 高速離心沉澱濃縮+1
01/25 00:06, 7F

01/27 20:38, , 8F
借問一下, PEG濃縮完的病毒可以用來感染primary neuron嗎?
01/27 20:38, 8F

01/27 20:39, , 9F
以及 是否可以用在in vivo呢? (把virus打進鼠腦)
01/27 20:39, 9F

01/27 20:40, , 10F
另外, 超高速離心 sw28 rotor 的tube 344058 不能封口
01/27 20:40, 10F

01/27 20:42, , 11F
要如何確保不會汙染呢? 可以封滅過菌的parafilm嗎?
01/27 20:42, 11F

01/27 20:42, , 12F
tube本身可以滅菌嗎?
01/27 20:42, 12F

01/27 20:43, , 13F
抱歉, 問題很多XDD 可是我google不到答案....
01/27 20:43, 13F

01/27 20:45, , 14F
先謝謝大家了 新年快樂~~
01/27 20:45, 14F

01/28 09:21, , 15F
1.可 2.可 3.344058是軟管,不建議reuse,355642硬管可滅
01/28 09:21, 15F

01/28 09:23, , 16F
4.轉的時候不能封,回溶時可封 5.硬管可滅但須注意是否破損
01/28 09:23, 16F

01/28 09:24, , 17F
至於保持無菌,只能多用點酒精擦sw28的蓋子。我校是公用so
01/28 09:24, 17F

01/28 14:43, , 18F
感謝HEK293大大解答~
01/28 14:43, 18F
文章代碼(AID): #1IuIAOXH (Biotech)
文章代碼(AID): #1IuIAOXH (Biotech)