請問收到定序結果檔案的後續動作
請教各位先進,一般你們收到定序的結果檔案後(.abi檔及.txt檔),會自己再
用如VectorNTI的軟體讀.abi檔後重組出contig(假設每個PCR產物樣本都做forward
及reverse兩端定序),還是就信了廠商那邊機器讀出來的序列,直接拿.txt裡的
序列去作後續分析?我個人通常是會用軟體自行重組,看著chromatogram過濾掉
低QV的位置或是人腦判讀forward和reverse組合起來不同的點的序列等等。因為
目前需要做的多為phylogenetic analysis和族群基因分析,很怕幾個位置若是廠
商的機器判讀錯誤,會影響最後的親緣關係圖。不過這樣做法耗神耗時,所以才
想請教各位的作法如何?謝謝。
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