[求救] 如何篩選 transmembrane protein ?
各位好,這個暑假進生化實驗室實習,
由於本身是讀化學的,生物方面的資訊不太清楚。
今天我要分析從細胞膜上萃取出的蛋白質體,
質譜分析完畢之後,使用Proteome Discoverer這個軟體,
把ID到的917個蛋白質之列表輸出。
結果如下:
https://goo.gl/bYyd9z
我用gominer.jar這個軟體可以知道,
哪一些蛋白質是屬於membrane protein,
但我現在想要知道,哪一些是屬於transmembrane protein,
這個軟體就無法告訴我了。
所以我想請問有沒有軟體可以篩選出transmembrane protein,
google了很久,不是找不到,就是看不懂如何使用
(有些要特定檔案格式? 反正我丟進去都沒成功)
如果可以,除了給我關鍵字之外,是否也可以教學一下
謝謝你看完這篇文章
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