[求救] 請問有辦法數攤開的細胞嗎?

看板Biotech (生命科學)作者 (NEET)時間9年前 (2015/12/09 16:13), 編輯推噓6(6014)
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目前實驗有些實驗需要數可見光的細胞,譬如單獨看貼附數量,或是BRDU這種的 ,我們的細胞是MSC或是fibroblast這種會不規則的,不像DAPI染色這種 大小接近,又可以輕鬆濾掉背景的照片,請問有辦法透過半自動的方式去數嗎? 如果用滑鼠去人工數,真的很傷眼,而且數累了也會開始有誤差,增加人力數就 耗人力。我不指望能完全自動化,但就算要人力,也希望只是邊邊確認一下,或是 把連太近的分開這種。請問有人試過嗎? -- 小黃小黃別生氣,明天帶妳去看戲。 我坐椅子妳坐地,我吃雞腿妳啃骨。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.137.85 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1449648806.A.CF3.html

12/09 19:34, , 1F
把細胞核染了呢?這樣明顯很多
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12/09 19:36, , 2F
只能睡可見光阿?為什麼不能染色呢?
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12/09 21:33, , 3F
用imageJ做標記啊,他會自動幫你計數 你只要把細胞
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都點到 檢查看有沒有沒上標的 數字他會幫你算
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12/10 09:26, , 5F
我以前用過Aperio的軟體, 有一個功能是計算細胞核的數量
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12/10 18:09, , 6F
還是要自己點啊?一張照片就有上千顆的...好想自動化
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12/10 21:31, , 7F
有high content sys嗎?染CFSE再scan細胞後用軟體可以
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算 不規則形狀也可以
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用了 BrdU 方式,最後不就會有顏色?而如果是一般貼附,處在
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12/10 21:34, , 10F
分裂期圓化像漂浮的細胞算不算?apoptotic cells 算不算?想
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來,半自動的話,大概也不會比你想像中的要省時許多。另外,
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點細胞這種事情,如果有手寫板的話會比較好用。用滑鼠太刻苦
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一兩盤還好,若是有幾萬個細胞要點,你還是來點音樂助興比較
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呃,是「緩和情緒」比較好點。加油了。
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12/11 14:37, , 15F
1.買有觸控螢幕的筆電 2.imageJ點
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有自動數細胞colony的機器…不過要近百萬
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12/12 18:41, , 18F
enu2/菌落计数/GelCount™/GelCount™.html
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12/13 08:19, , 19F
GelCount是用來算colony的不是嗎?原po不是要算colony。
12/13 08:19, 19F

12/13 08:20, , 20F
話說回來,這種機器比較適合大單位擁有,小實驗室負擔不起。
12/13 08:20, 20F
文章代碼(AID): #1MP-Acpp (Biotech)
文章代碼(AID): #1MP-Acpp (Biotech)