[討論] 請問版上有人用過Maxquant 分析SILAC嗎?

看板Biotech (生命科學)作者 (小G)時間9年前 (2016/09/10 15:18), 編輯推噓2(200)
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我是利用UPLC-MS/MS 分析完的raw data ,有用SILAC heavy和 light label細胞,然後將 這個Raw data 拿去跑Maxquant ,操作是參考2016Maxquant summer school的影片學的( YouTube),但是分析完有許多protein的ratio 顯示沒有任何值或意義,後來發現是有全有 全無的現象,也就是說heavy 和light 其中一個signal 是得到0這個intensity ,如果不 希望算出來的值是沒有意義,就必須要有最低值的設定,把0設定成100之類的,請問版上 有人有相關經驗的嗎?有用過Maxquant 的版友可站內信一起討論,謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.109.40.70 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1473491886.A.A59.html

09/10 17:45, , 1F
樓主是強者 快拜 (
09/10 17:45, 1F

09/22 10:44, , 2F
可以利用persus分析,他有用分佈補足ratio
09/22 10:44, 2F
文章代碼(AID): #1NqxEkfP (Biotech)
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