[討論] 請問版上有人用過Maxquant 分析SILAC嗎?
我是利用UPLC-MS/MS 分析完的raw data ,有用SILAC heavy和 light label細胞,然後將
這個Raw data 拿去跑Maxquant ,操作是參考2016Maxquant summer school的影片學的(
YouTube),但是分析完有許多protein的ratio 顯示沒有任何值或意義,後來發現是有全有
全無的現象,也就是說heavy 和light 其中一個signal 是得到0這個intensity ,如果不
希望算出來的值是沒有意義,就必須要有最低值的設定,把0設定成100之類的,請問版上
有人有相關經驗的嗎?有用過Maxquant 的版友可站內信一起討論,謝謝
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