[求救] 電轉後細胞會aggregate

看板Biotech (生命科學)作者 (phoebe)時間8年前 (2017/09/05 11:16), 8年前編輯推噓2(2011)
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大家好: 想請問電轉mammalian cell的問題。 我的細胞是vero,電轉的核酸是~30k的RNA protocol大致如下: 細胞會前一天繼代到175T,實驗當天約8-9分滿 Trypsin 2ml下去後等約五分鐘,細胞都變圓變亮後輕敲detach medium回溶後4度離心,去除上清液 PBS wash兩遍後細胞計數,並回溶到適當濃度 (1x10^7/ml) 將RNA加入細胞(0.8 ml)後加入0.4 cm的cuvette 參數是4 pulses at 450V, 50uF 細胞hood內recover 10 min,transfer到已回溫complete growth medium 隔天觀察細胞 我的問題是,電轉完後我的PBS-cell suspension都會有很多泡泡,這是正常的 但細胞常常會aggregate在一起,變得跟鼻涕一樣濃稠 然後似乎aggregate越多,代表細胞viability越差,會貼下去的細胞越少 但我不太確定這可能是哪個步驟所造成的。 是細胞本人(新解凍約第5代)? Detachment過程 (trpsin下去後rinse幾遍就會倒掉然後等細胞rounding)? 電轉的buffer? 因為實驗需求,貼下去的細胞之後還要再碰trypsin,所以要有一定的滿度,不然就GG了 不知道有沒有人有經驗可以分享的,有那些小細節我可能沒注意到造成細胞存活下降 還有要怎麼避免細胞Aggregate的問題 大感謝>"< -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.4.208 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1504581372.A.1FE.html ※ 編輯: kaofei (140.112.4.208), 09/05/2017 11:17:05 ※ 編輯: kaofei (140.112.4.208), 09/05/2017 11:18:23

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我猜是細胞死掉釋放出 DNA 把細胞纏在一起造成的?
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我有看到這個說法,也看到有人說可以加DNase來避免,但不
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知道是否真的可行XD" 或我有辦法後處理把他們鬆開嗎?
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是不是吸到泡泡了?電轉的時候我不會去吸那些,那
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些是死細胞
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我就是用1000ul的tip能吸的都吸起來,但我沒用medium
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※ 編輯: kaofei (140.112.4.208), 09/05/2017 11:59:02

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去wash cuvette下次會記得...所以泡跑不要吸,鼻涕樣物呢?
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我會用200uL的tip先把結成團的泡泡移到壁上,再盡
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量吸剩下的medium,這樣做我沒看過鼻涕樣的東西,
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但不免還是有一點細胞碎片就是。
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我在想那些泡泡就是細胞糾纏在一起混合鼻涕的東西
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,可以試試另外取出來用顯微鏡證實。
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benzonase可以試看看
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文章代碼(AID): #1PhXRy7- (Biotech)
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