[情報] 多體學分析應用講座

看板Biotech (生命科學)作者yaowei2010 (yaowei)時間7年前 (2018/06/05 10:15)推噓0(0推 0噓 0→)

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活動名稱：多體學分析應用講座在本次創源生技與QIAGEN共同舉辦的【多體學分析應用, Multi-Omics Analysis to Precision Medicine】講座中。藉由分享各生命科研資訊分析軟體，期望提供各位在基因定序資訊自拼裝到後續意義闡釋，皆有相對應之產品為您做最佳化的產出，並從不同的生物表現階層皆得以切入。此次研討會中，我們將介紹QIAGEN NGS Bioinformatics Solution，包含OmicSoft、CLC Genomics Workbench、Ingenuity Pathway Analysis及 Ingenuity Variant Analysis等多個國際知名產品介紹，在基因資訊分析上既有各自功能特色，也能相互串接，讓您在不同平台的分析上體驗完美接軌的使用經驗。。本次講座中，我們邀請到了OmicSoft全球產品經理Dr. Nirav Amin與各位做介紹， OmicSoft不僅為次世代定序或基因晶片等高通量資料之整合平台，更提供後端資訊意義分析平台串接，讓您在OmicSoft分析平台中，自初始資訊至結果闡釋，皆在同一分析介面完成。OmicSoft更提供伺服器端與客戶端電腦分析的功能，除了節省客戶端硬體端的空間，更能隨時從伺服器端上分析自己的資料，針對生物資訊學家，也能使用R等程式語言客製化自己的分析流程。此外，OmicSoft在內部蒐集並整理各種現有知名計畫的資料庫，如 TCGA、CCLE、1000 Genome Project等資料集，提供使用者驗證或分析，透過雲端上分析與OmicSoft資料庫的比對，得以支援進行大規模的基因體研究項目，將研究層級的視野擴展至更大量數據的範圍。另外，創源分子視算中心陳冠文經理將為各位介紹CLC Genomics Workbench 、IPA (Ingenuity Pathway Analysis)及 IVA (Ingenuity Variant Analysis)之軟體功能及應用，三項產品分別提供使用者簡單易用的操作介面，自序列拼裝至變異體分析以及訊息路徑分析，滿足不同且橫跨上下游的分析需求。。隨著技術的成熟與定序成本下降，體學分析至今已無法滿足醫學研究於臨床上的分析需求，多體學分析與整合成為顯學，近年來國內外之技術進展甚至朝向轉譯後修飾與微生物體學分析，探究人體微環境中多種生命互動之影響。本次講座很榮幸能邀請您前來參加一同分享我們的產品經驗，相信定能刺激出新的實驗想法與提升多體學研究的視野，期待您的蒞臨。 CLC-Bio主要專注在定序或晶片等高通量資料產出之初始資料的拼裝整合，並針對不同定序型式，如基因體全定序、外顯子全定序、RNA定序或微生物體學定序資料設計自動化資料處理流程，透過一鍵按鈕快速地讓使用者得到想要的分析結果，甚至能讓使用者去設計屬於自己的自動化資料處理流程。並提供各種資料圖型視覺化功能，更能同時將不同層級得資訊在同一個基因體軌跡上進行多重比對。同時也針對最近生物技術學界上關注的問題釋出相對應的擴充套件來增加CLC-Bio的分析功能。CLC bio 提供生物資訊軟體使用者簡易的使用頁面及分析串流，讓你在最短的時間內達到最佳的序列拼裝及分析成果。而在CLC資訊處理後，IVA (Ingenuity Variant Analysis)，能為您找尋樣本中的基因變異資訊。在IVA當中, 收錄資訊的來源包含1000 genomes project, OMIM, COSMIC及HGMD 等資料庫，收錄現今最完整的人體變異資訊。針對特定變異資訊，可在IVA設定上設計不同分析類別(case & control)，以找出已知及未知的變異，另外針對於變異特性篩選上，如Cancer type及特定遺傳疾病相關的變異等；或是根據變異預測protein function 是否對人體有害。IVA可透過設定12種不同變異條件的篩選，快速的在大量基因變異中為您分析出符合篩選條件的變異基因，並進一步對應到您對於樣本收錄的表型。另外在篩選條件 Filter的設定上是可記憶您設定值，能在大量分析中達到半自動化的功能。IVA為您提供快速且具有最豐富的變異比較資訊。而在後端資訊意義結果闡釋及假說建立上，IPA生物路徑分析軟體包含可信的資料來源及分析演算法，為目前全球系統生物學與訊息路徑分析領導品牌，不僅廣泛地被許多科研團體採用，在許多學術期刊中也大量地被引用。在實驗結果分析或是分子搜尋上，IPA不僅能演示單一變因實驗之分子調控，也能整合不同細胞層級之分析數據，如RNA-seq、miRNA 和SNP之實驗資料、代謝體學分析及蛋白質體學分析等，讓您在完整的生物系統背景下識別新的目標基因或候選生物標記，顯現出 “體學數據” 之重要性。另外， IPA通過結合 Omicsoft資料庫，提供實驗結果分析匹配結果。我們可以深入了解您實驗結果的生物學機制，並根據大量共享數據所獲取的資訊建立假說與全新的實驗見解。活動免費參加，備有茶點，座位有限!!!!!!!! 活動報名網址：https://goo.gl/FLGPqd 主辦單位：創源生物科技股份有限公司(QIAGEN、達梭系統BIOVIA產品的代理商) 共同舉辦：QIAGEN 日期：2018年6月15日(五) 時間：09:20 - 12:00 (09:00開始入場) 地點：北科大集思會議中心 - 西特廳地址：106 台北市大安區忠孝東路三段1號(億光大樓) 聯繫窗口：02-2795-1777#3027 蔡小姐 (0970-592-093) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 123.51.171.216 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1528193738.A.9F6.html