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[求救] primer predict

看板Biotech (生命科學)作者 (啃琳)時間7年前 (2018/06/15 16:21), 編輯推噓0(0推 0噓 8→)
留言8則, 3人參與, 7年前最新討論串1/1
------我是菜逼八碩一如果提出很菜的問題可以罵但請各位大大罵完還是能幫個忙解答-- ------ 最近在嘗試把一隻放線菌的ori用pcr的方式挑出來，但設計出來的primer F會亂黏，所以 要重新設計primer。 教授要我設計完去predict看看primer會不會再亂黏（上次忘記先predict），想請教各位 大大整個放線菌genome大概三百萬mer（超大），有沒有什麼軟體是適合這麼大的genome 。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.141.78.232 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1529050886.A.CDA.html
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06/15 18:22, 7年前 , 1F
NCBI primer BLAST 系統就可以做了，不過我不知道 NCBI
06/15 18:22, 1F
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06/15 18:23, 7年前 , 2F
有沒有 Actinobacteria 的 genome sequence
06/15 18:23, 2F
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06/16 00:06, 7年前 , 3F
謝謝~~~
06/16 00:06, 3F
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06/16 00:07, 7年前 , 4F
NCBI都只有片段 這也是個問題
06/16 00:07, 4F
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06/16 01:28, 7年前 , 5F
提醒一下 看專一性primer blast不用自己貼Template
06/16 01:28, 5F
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06/16 01:29, 7年前 , 6F
底下物種選對 整個genome就幫你比對了
06/16 01:29, 6F
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06/16 01:30, 7年前 , 7F
放射菌屬的genome有喔 但只能比nr資料庫
06/16 01:30, 7F
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06/16 16:40, 7年前 , 8F
好的~~~謝謝
06/16 16:40, 8F
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