[求救] 16smetagenomcis與培養法的結果不同?

看板Biotech (生命科學)作者 (PETER J)時間6年前 (2018/07/03 10:42), 編輯推噓1(105)
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發問時請注意,若是要問實驗相關的問題,請將實驗的步驟、所用的條件大致列出 以方便板友幫您追蹤問題 若是求救事項涉及實驗室智慧財產(例如細胞細菌植株、質體載體等)之分讓, 請務必註明貴實驗室願意設立 正式合作 簽署材料分讓協議(MTA),否則版工將逕行刪除 ----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章---- 請教各位學長姐,在環境採樣後進行微生物培養與菌種鑑定及16S rRNA metagenomics 的分析後,結果發現培養法中CONS分離最多,但在metagenomics結果分析上以不動桿菌屬 最為豐富.造成這樣結果如何解釋? 培養法與16S rRNA metagenomics結果不同地方在哪? 我知道培養法能分離出活菌種,但有99%以上的環境菌無法培養 metagenomics是可以分析培養法無法分離培養的菌 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 120.106.210.29 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1530585749.A.612.html

07/03 15:14, 6年前 , 1F
所有的培養都是enrichment 只有喜歡你的培養環境的會
07/03 15:14, 1F

07/03 15:14, 6年前 , 2F
07/03 15:14, 2F

07/06 09:14, 6年前 , 3F
結果不同的地方是指什麼?請表達清楚
07/06 09:14, 3F

07/06 21:57, 6年前 , 4F
我培養法培養出Cons菌種最多
07/06 21:57, 4F

07/06 21:58, 6年前 , 5F
但在16s metagenmic葡萄球菌屬不是很豐富
07/06 21:58, 5F

07/12 12:01, 6年前 , 6F
活菌死菌的差異也會有影響,NGS死活都看,培養法只看活菌
07/12 12:01, 6F
文章代碼(AID): #1REkALOI (Biotech)
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