PTT職涯區 / Biotech (生命科學)

[求救] 打Mass結果判斷

看板Biotech (生命科學)作者 (傑斯 siston)時間6年前 (2018/11/29 04:05), 編輯推噓3(3推 0噓 15→)
留言18則, 6人參與, 6年前最新討論串1/1
各位前輩好，下圖為打Mass後的結果圖，樣品是二維電泳中不確定的點，想請問該如何從 圖中的資訊判定該點為何種蛋白，該參考哪些資訊，非常感謝各位的幫助 https://i.imgur.com/o5XBYar.jpg
-- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 101.13.41.252 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1543435519.A.3AD.html
→
11/29 07:24, 6年前 , 1F
序列一條一條copy起來去blast啊不然勒
11/29 07:24, 1F
→
11/29 08:41, 6年前 , 2F
大大，不好意思，小弟門外漢，能否講的詳細一些，感
11/29 08:41, 2F
→
11/29 08:41, 6年前 , 3F
謝
11/29 08:41, 3F
推
11/29 08:46, 6年前 , 4F
你選擇大鼠資料庫，若沒找到結果，可以用 blast 來搜尋
11/29 08:46, 4F
→
11/29 08:46, 6年前 , 5F
其他資料庫;blast是序列的google工具
11/29 08:46, 5F
→
11/29 13:10, 6年前 , 6F
這是我第一次看這種報告，如果我搞錯還請指正，這報告
11/29 13:10, 6F
→
11/29 13:13, 6年前 , 7F
這應該可信度不低吧 質譜打出的片段 有對到CYTB_RAT 3個位
11/29 13:13, 7F
→
11/29 13:13, 6年前 , 8F
置 佔了全部序列的79%
11/29 13:13, 8F
→
11/29 13:14, 6年前 , 9F
因為用 Trypsin 切 每段的屁股都是K
11/29 13:14, 9F
→
11/29 13:15, 6年前 , 10F
不就寫了樣本比對結果是 Rat 的 Cystatin B 嗎？
11/29 13:15, 10F
→
11/29 13:15, 6年前 , 11F
啊 5段序列
11/29 13:15, 11F
→
11/29 13:16, 6年前 , 12F
連胺基酸對應到的部份都列給你了耶？下面那些個別的序
11/29 13:16, 12F
→
11/29 13:17, 6年前 , 13F
列就是中間那 Matched peptides shown in Bold Red 中
11/29 13:17, 13F
→
11/29 13:17, 6年前 , 14F
的部份啊
11/29 13:17, 14F
推
11/29 17:20, 6年前 , 15F
79% coverage應該就是了 不過peptide 沒給斷片資訊第
11/29 17:20, 15F
→
11/29 17:20, 6年前 , 16F
一次看到@@
11/29 17:20, 16F
推
11/29 17:25, 6年前 , 17F
Miss 是指trypsin missing cleavage 的peptide 段
11/29 17:25, 17F
→
11/29 19:31, 6年前 , 18F
好的，十分感謝樓上各位的協助～小弟了解了
11/29 19:31, 18F
‣ 更多 jeffchu731 的文章
文章代碼(AID): #1R_lJ_Ej (Biotech)
Biotech 近期熱門文章
更多 近期熱門文章 >>
PTT職涯區 即時熱門文章
更多 即時熱門文章 >>
‣ 更多 jeffchu731 的文章
文章代碼(AID): #1R_lJ_Ej (Biotech)