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牛的RNA Variant DNA Varient

看板Biotech (生命科學)作者 (ChenJhih)時間5年前 (2019/05/14 22:44), 編輯推噓4(4推 0噓 18→)
留言22則, 5人參與, 5年前最新討論串1/1
https://i.imgur.com/TKvOota.jpg
小弟最近在研究牛的基因，想知道如何從e!semble這個網站獲得RNA Variant、DNA Varie nt。（目前只知道上圖的T/C是RNA Variant ...) 麻煩各位大神指點 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 115.82.232.170 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1557845052.A.76C.html
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05/14 22:52, 5年前 , 1F
有看到上面有一個tab寫help & docs嗎? 那個點下去
05/14 22:52, 1F
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05/14 23:02, 5年前 , 2F
你搞錯了，給的附圖是DNA variant阿
05/14 23:02, 2F
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05/15 08:20, 5年前 , 3F
我一開始認為是DNA variant，不過傳mail問journal作者
05/15 08:20, 3F
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05/15 08:20, 5年前 , 4F
跟我說是RNA variant...
05/15 08:20, 4F
推
05/15 13:01, 5年前 , 5F
VCF:29ꂠ46165505ꂠrs42194371ꂠTꂠC，這代表是染色體29
05/15 13:01, 5F
推
05/15 13:03, 5年前 , 6F
VCF:29 46165505 rs42194371 T C這是代表染色體29號的
05/15 13:03, 6F
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05/15 13:03, 5年前 , 7F
位置，染色體只有一個方向，所以是DNA變異
05/15 13:03, 7F
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05/15 15:41, 5年前 , 8F
感謝各位的回答，我要去嘴砲論文作者了（開玩笑）
05/15 15:41, 8F
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05/16 07:36, 5年前 , 9F
這是作者的回覆，他
05/16 07:36, 9F
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05/16 07:36, 5年前 , 10F
講的同樣是上圖，想請大神求助...
05/16 07:36, 10F
推
05/16 08:12, 5年前 , 11F
你們真的是照SNP id在討論嗎？ 沒有前後文沒法判斷教授
05/16 08:12, 11F
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05/16 08:12, 5年前 , 12F
是不是有誤解，建議你去找生資夥伴討論細節
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05/16 10:52, 5年前 , 13F
呃....我記得 DNA variant 和 RNA variant 概念上是不
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05/16 10:52, 5年前 , 14F
一樣的東西，因為 RNA 是以 DNA 為模板做出來的，所以
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05/16 10:53, 5年前 , 15F
DNA variant 會直接反應在 RNA 上(如果這個 DNA varian
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05/16 10:54, 5年前 , 16F
t 位於會做出 RNA 的序列上)；RNA variant 應該是指在
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05/16 10:56, 5年前 , 17F
transcription 時，由不同的TSS、alternative splicing
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05/16 10:57, 5年前 , 18F
或使用不同 polyA signal 而產生不同的 RNA 產物，這無
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05/16 10:58, 5年前 , 19F
官 DNA 序列有無不同都會產生，雖然 DNA variant可能影
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05/16 10:59, 5年前 , 20F
響能產生哪些 RNA variant，但他們概念上應該是不同的
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推
05/16 13:38, 5年前 , 21F
網站中已經有寫到RNA變異NSBTAT00000068819.1:c.*1324A>
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05/16 13:38, 5年前 , 22F
G，我猜是認知不同造成的差異
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