[求救] 染色Intensity的定量軟體?

看板Biotech (生命科學)作者steve42125 (Shiburin)時間5年前 (2019/08/06 17:59)推噓2(2推 0噓 1→)

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最近在幫老師處理一批PAS染色的組織切片透過ImageJ的插件將圖片拆成藍跟紅後可以設定Threshold 順利定量出Positive staining area percentage 但老師希望能夠更進一步地去看Staining intensity 但是不管怎麼google都找不到適合的方法看到有人說把Mean gray value打開就是mean intensity 但是我後來看了一下定義好像不太對想知道有什麼方法可以把染色的intensity測出絕對的數值? 因為Glomerulus裡面會有一些空洞想說能不能圈起一顆glomerulus後，程式自己讀出這顆glomerulus整體被染色的強度自然就會排除掉空洞的影響。真的找不到合適的方法，希望有經驗的各位可以提供你們使用imageJ的經驗或著其他軟體我也可以試試看先謝謝各位了！ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 120.126.49.54 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1565085558.A.B5B.html

推

loveoldbear

08/06 20:27, 5年前 , 1^F

08/06 20:27, 1^F

剛有稍微查一下，貌似功能滿豐富的但看起來好像是需要由學校購買授權這樣現在就沒辦法用了可惜但還是謝謝 ※ 編輯: steve42125 (1.161.17.53 臺灣), 08/06/2019 20:31:30 ※ 編輯: steve42125 (1.161.17.53 臺灣), 08/06/2019 20:37:01