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[討論] 有關NGS和real-time pcr的數據

看板Biotech (生命科學)作者 (xmushroom)時間3年前 (2021/03/04 22:57), 編輯推噓8(8推 0噓 12→)
留言20則, 9人參與, 3年前最新討論串1/1
我是來自某大學的醫技系學生，想問這裡的各位前輩一個問題 如果今天用a藥物刺激b細胞後，將b細胞拿去給廠商分析NGS後發現有有幾個miRNA和control組的比起來是上升的 那麼我再拿刺激a藥物的b細胞做real-time pcr，那我real-time pcr的miRNA數據也會和NGS的數據一樣是上升的嗎？ 先謝謝大家的回答 ----- Sent from JPTT on my iPad -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 27.242.10.87 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1614869832.A.257.html
推
03/04 22:59, 3年前 , 1F
找廠商的specialist
03/04 22:59, 1F
→
03/04 23:15, 3年前 , 2F
大學生送sample給廠商作NGS,是幸還是不幸？
03/04 23:15, 2F
推
03/05 06:06, 3年前 , 3F
答案是看狀況
03/05 06:06, 3F
推
03/05 12:35, 3年前 , 4F
大致上我們會 推測 兩種方法看到的 miRNA 表現趨勢相同
03/05 12:35, 4F
→
03/05 12:36, 3年前 , 5F
但是如果你想看特定 miRNA 表現量是否都增加很多倍
03/05 12:36, 5F
→
03/05 12:37, 3年前 , 6F
那就不一定了 方法差異導致
03/05 12:37, 6F
推
03/05 17:42, 3年前 , 7F
這個問題可以跟學校的核心設施人員聊阿
03/05 17:42, 7F
推
03/07 14:03, 3年前 , 8F
沒有絕對啦，整個實驗不可見的變因太多，多次確認才
03/07 14:03, 8F
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03/07 14:03, 3年前 , 9F
可以知道趨勢，但這個趨勢也未必是正確的，所以要多
03/07 14:03, 9F
→
03/07 14:03, 3年前 , 10F
方驗證。同一種藥不同次送，不同人做，甚至廠商不同
03/07 14:03, 10F
→
03/07 14:03, 3年前 , 11F
批次檢測有可能造成不同，所以多做幾次，小心求證。
03/07 14:03, 11F
→
03/09 13:07, 3年前 , 12F
我常常結果都不一樣@@
03/09 13:07, 12F
推
03/12 11:28, 3年前 , 13F
表達量高,有生物性重複尤其是動物實驗,ILMN定序 的可重
03/12 11:28, 13F
→
03/12 11:28, 3年前 , 14F
複機會高
03/12 11:28, 14F
推
03/17 13:49, 3年前 , 15F
不一定耶~real time PCR驗證出來的結果有時候甚至會相反
03/17 13:49, 15F
→
03/17 13:49, 3年前 , 16F
XD所以在篩選candidate 的時候會挑選比較可能真的有差異
03/17 13:49, 16F
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03/17 13:49, 3年前 , 17F
的，例如有顯著差異且fold change前幾名的，或者是透過p
03/17 13:49, 17F
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03/17 13:49, 3年前 , 18F
aper research 看到有人驗證過相關機制的，這樣會比較容
03/17 13:49, 18F
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03/17 13:49, 3年前 , 19F
易找到預期中想看的基因
03/17 13:49, 19F
推
03/19 11:00, 3年前 , 20F
理論上會上升 實際做出來就不一定了
03/19 11:00, 20F
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