[求救] 藥物敏感性菌株同樣也有胺基酸突變

看板Biotech (生命科學)作者 (Inequality_c)時間3年前 (2021/04/08 16:14), 3年前編輯推噓4(4022)
留言26則, 4人參與, 3年前最新討論串1/1
各位大大好 小妹目前正在研究臨床菌株的抗藥性產生原因 (以下的抗藥性/敏感性菌株=對同一種藥物的感受性) 原本觀察到在這些抗藥性菌株的胺基酸序列上A, B位點有point mutation 心想太好了總算被我找到(? 結果上次口試中被口委說到必須加入敏感性菌株做比較 否則無法確認可信度 因此小妹又加入了敏感性菌株做比較 結果發現在敏感性中A, B位點一樣point mutation..... 我真是腦袋快燒掉 有問過實驗室的研究助理 他說:那只好在PCR另外一段囉 基因全長1980bp 我已經P了900 在P另一半不知道會不會有很大的風險(因為必須在三個 月內趕完論文口試 但是我的臨床菌株非常多) 想求救大大們有沒有什麼想法可以給小妹一點指引 因為產生抗藥性的原因實在太多...不知道是不是我一開始就下錯方法分析了 謝謝大家(跪 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 114.137.153.39 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1617869651.A.F6D.html ※ 編輯: song4231 (114.137.153.39 臺灣), 04/08/2021 16:15:34

04/08 16:41, 3年前 , 1F
因為抗藥性原因很多…所以你之前為什麼會覺得該基因
04/08 16:41, 1F

04/08 16:41, 3年前 , 2F
的point mutation是導致抗藥性的原因呢?有ref可以
04/08 16:41, 2F

04/08 16:41, 3年前 , 3F
佐證你的假設嗎?你有用未突變的基因塞回去表現看看
04/08 16:41, 3F

04/08 16:41, 3年前 , 4F
抗藥性有沒有消失嗎?
04/08 16:41, 4F

04/08 17:21, 3年前 , 5F
因為這表示一開始判定的A跟B可能不是專門針對抗藥性的突變
04/08 17:21, 5F

04/08 19:06, 3年前 , 6F
根據內文敘述 A 跟 B 很顯然不是抗藥性的成因
04/08 19:06, 6F

04/08 19:09, 3年前 , 7F
我其實不是很懂把剩下一千多base 定個序難在哪
04/08 19:09, 7F

04/08 19:10, 3年前 , 8F
現在比較會擔心得的確是 抗藥性的產生會不會根本跟你
04/08 19:10, 8F

04/08 19:10, 3年前 , 9F
研究的目標基因無關?
04/08 19:10, 9F

04/08 21:42, 3年前 , 10F
你可能要先看看你設定的抗生素是哪種? 在主要抗藥機制
04/08 21:42, 10F

04/08 21:42, 3年前 , 11F
突變與外來plasmid中哪種的可能性會比較大
04/08 21:42, 11F

04/08 21:43, 3年前 , 12F
因為你只剩三個月 其實若A/B的假設已經不成立 你需要趕快
04/08 21:43, 12F

04/08 21:44, 3年前 , 13F
變更實驗主題 最低限度是做類似公衛/流行病學的分析
04/08 21:44, 13F

04/08 21:45, 3年前 , 14F
就是狂P 哪種已知突變或plasmid最多種
04/08 21:45, 14F

04/08 21:47, 3年前 , 15F
然後看看你手頭上的菌株資料 如分離年份與菌種 能否看出
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04/08 21:48, 3年前 , 16F
一些分佈上的差異然後做統計
04/08 21:48, 16F

04/08 21:51, 3年前 , 17F
3當然外來基因也有可能不見得是plasmid但總歸要找個主題
04/08 21:51, 17F

04/08 21:53, 3年前 , 18F
如果仍然是要做抗藥性機制 然後要篩全新未知突變點
04/08 21:53, 18F

04/08 21:54, 3年前 , 19F
那就不能只做一個基因而已了 可能要NGS 但你時間與實驗室預
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04/08 21:54, 3年前 , 20F
算可能不及
04/08 21:54, 20F

04/08 21:55, 3年前 , 21F
你需要跟老闆好好討論一下 最後三個月能衝些什麼方向
04/08 21:55, 21F

04/09 02:39, 3年前 , 22F
只能說,你沒有驗證過A、B位點的突變就是導致抗藥性這
04/09 02:39, 22F

04/09 02:40, 3年前 , 23F
點,真的是太天真了.....至少也該把基因clone出來,把
04/09 02:40, 23F

04/09 02:41, 3年前 , 24F
突變修好後換回去之類的方法驗證過A、B突變對抗藥性的
04/09 02:41, 24F

04/09 02:41, 3年前 , 25F
影響,單單只是看到有突變就認定是該突變的影響,你做
04/09 02:41, 25F

04/09 02:41, 3年前 , 26F
研究會有很大的問題....
04/09 02:41, 26F
文章代碼(AID): #1WRhjJzj (Biotech)
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