[求救] 單點突變的mouse genotyping

看板Biotech (生命科學)作者 (有人試我的密碼,幹)時間3年前 (2021/08/20 11:10), 3年前編輯推噓2(207)
留言9則, 5人參與, 最新討論串1/1
以前只做過有插入tag或是Knock-out的mouse genotyping, 現在工作上有老鼠 只在單一個nucleotide做point mutation(A/C or T/G), 實驗室以前都是做出來送sanger, 不知道板上的各位有沒有啥方法 可以降低成本,能不能只跑膠或是real-time PCR的方式 就能分出genotype? Thanks -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 39.13.3.70 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1629429057.A.6B6.html ※ 編輯: pent (39.13.3.70 臺灣), 08/20/2021 11:11:21

08/20 11:58, 3年前 , 1F
Taqman,自己設計primer跟probe,分別標FAM跟VIC或HEX
08/20 11:58, 1F

08/20 12:00, 3年前 , 2F
如果是已知的位點或許Thermo會有set,不過老鼠的機率不大
08/20 12:00, 2F

08/20 14:01, 3年前 , 3F
HRM
08/20 14:01, 3F

08/20 15:13, 3年前 , 4F
看有沒有新增酵素切位囉,有的話就PCR 切酵素 跑膠
08/20 15:13, 4F

08/20 18:47, 3年前 , 5F
你搜尋「SNP genotyping」就有了,用LNA做probe準確度
08/20 18:47, 5F

08/20 18:47, 3年前 , 6F
很高
08/20 18:47, 6F

08/24 20:04, , 7F
Mutagenically separated polymerase chain reaction (M
08/24 20:04, 7F

08/24 20:04, , 8F
S-PCR)
08/24 20:04, 8F

08/24 20:07, , 9F
跑膠就能分,只是膠的%數2%以上比較好
08/24 20:07, 9F
文章代碼(AID): #1X7nr1Qs (Biotech)
文章代碼(AID): #1X7nr1Qs (Biotech)