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討論串[問題] DNA定序之後的問題
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#5
Re: [問題] DNA定序之後的問題
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者pocession (阿宗)時間19年前 (2006/11/11 22:59), 編輯資訊
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會產生問題的地方太多了. 你把基因弄出來後已經PCR一次. clone完後定序時又PCR一次~~. 每次PCR中其實又複製了好多次. 當然這都是我們沒辦法控制的. 先不管這個. 要增加準確度我們可以控制的在於. 1. 序列多讀幾次，起碼從頭和尾各一次，當然這還是不夠. 2. 送序的序列最好為基因的全
#4
Re: [問題] DNA定序之後的問題
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者circleming (新世紀音樂)時間19年前 (2006/11/04 11:15), 編輯資訊
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不好意思.... 不知道是不是我沒搞懂問題，. Polymerase (如Taq）的fidelity也會有差吧？. 還是這些問題都已經排除了，. 所以拿到的sequence是最終修正後的結果？. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 12.206.233.228.
#3
Re: [問題] DNA定序之後的問題
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者Mouseking (叫我老鼠王....-_-)時間19年前 (2006/11/04 01:35), 編輯資訊
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好奇問一下....你有拿掉原先vector上multiple cloning site到使用primer之間的. 序列嘛？我上次是忘記拿掉所以沒有100％......如果有....我想是機器問題多一點. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 210.58.54.177
#2
Re: [問題] DNA定序之後的問題
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者chiehgriffin (...)時間19年前 (2006/11/03 15:00), 編輯資訊
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可以去看看定序序列的raw data，也就是peak，通常定序的長度差不多都在1Kb或是. 少於，而且剛開始或是最後序列無法判定的情形是常見的，建議您親自看看peak. profile。. 另外可能您的基因有mutation也說不定阿！. 參考一下.... --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt
#1
[問題] DNA定序之後的問題
推噓4(4推 0噓 1→)留言5則，0人參與, 最新作者lovepig414 (pig)時間19年前 (2006/11/03 11:55), 編輯資訊
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各位大大. 小弟以本實驗室的細胞株做了RT-PCR後，之後再做clone完後，送生技公司做定序，. 定序完成後，上了NCBI做序列比對，發現自己做的定序和資料庫上的定序相似. 度高達98%，我想應該是很高吧，所以推測此細胞應該是有此基因，然而，我的. 老闆卻問我了一個問題，就是為什麼相似度不是100
(還有121個字)
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