Re: [問題] DNA定序之後的問題

看板Biotech (生命科學)作者Mouseking (叫我老鼠王....-_-)時間19年前 (2006/11/04 01:35)推噓0(0推 0噓 0→)

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※ 引述《chiehgriffin (...)》之銘言： : ※ 引述《lovepig414 (pig)》之銘言： : : 各位大大 : : 小弟以本實驗室的細胞株做了RT-PCR後，之後再做clone完後，送生技公司做定序， : : 定序完成後，上了NCBI做序列比對，發現自己做的定序和資料庫上的定序相似 : : 度高達98%，我想應該是很高吧，所以推測此細胞應該是有此基因，然而，我的 : : 老闆卻問我了一個問題，就是為什麼相似度不是100%?要我做回覆！ : : 我自己想的結論是： : : 1.也許是機器的問題，本身就有錯誤率！(但是機器做出錯誤的 : : 機率是很低的！) : : 2.也許是基因上本身就有一點不一樣，但是轉譯出的protein : : ，可能會是相同的！(這個可以做胺基酸比對得知。) : : 再來我就不太知道為什麼了，自己也上網站找尋了一下，但是真的找不太到相 : : 關的資料，不知道板上的大大們，有沒有人可以幫幫我啊！再過幾天就要meeting， : : 可是我卻如此的不知所以然，救救我吧！感恩阿！ : 可以去看看定序序列的raw data，也就是peak，通常定序的長度差不多都在1Kb或是 : 少於，而且剛開始或是最後序列無法判定的情形是常見的，建議您親自看看peak : profile。 : 另外可能您的基因有mutation也說不定阿！ : 參考一下... 好奇問一下....你有拿掉原先vector上multiple cloning site到使用primer之間的序列嘛？我上次是忘記拿掉所以沒有100％......如果有....我想是機器問題多一點 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 210.58.54.177