[問題] DNA定序之後的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (pig)時間19年前 (2006/11/03 11:55), 編輯推噓4(401)
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各位大大 小弟以本實驗室的細胞株做了RT-PCR後,之後再做clone完後,送生技公司做定序, 定序完成後,上了NCBI做序列比對,發現自己做的定序和資料庫上的定序相似 度高達98%,我想應該是很高吧,所以推測此細胞應該是有此基因,然而,我的 老闆卻問我了一個問題,就是為什麼相似度不是100%?要我做回覆! 我自己想的結論是: 1.也許是機器的問題,本身就有錯誤率!(但是機器做出錯誤的 機率是很低的!) 2.也許是基因上本身就有一點不一樣,但是轉譯出的protein ,可能會是相同的!(這個可以做胺基酸比對得知。) 再來我就不太知道為什麼了,自己也上網站找尋了一下,但是真的找不太到相 關的資料,不知道板上的大大們,有沒有人可以幫幫我啊!再過幾天就要meeting, 可是我卻如此的不知所以然,救救我吧! 感恩阿! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.127.215.11

11/03 13:19, , 1F
同種內的生物在個體間有種內變異...很正常...
11/03 13:19, 1F

11/03 23:40, , 2F
PCR也是會出錯的呀...不是mutation應該就是PCR的問題
11/03 23:40, 2F

11/03 23:41, , 3F
當然定序也可能出問題...去看一下定序的peak吧
11/03 23:41, 3F

11/04 02:22, , 4F
PCR很容易出錯阿,放大再放大...
11/04 02:22, 4F

11/04 19:54, , 5F
DNA聚合脢用哪種?Taq?錯誤率多少?
11/04 19:54, 5F
文章代碼(AID): #15Iht3lD (Biotech)
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