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Re: [轉錄][求救] 有關FASTA format

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (漢堡)時間16年前 (2008/06/02 21:12), 編輯推噓5(5推 0噓 8→)
留言13則, 5人參與, 最新討論串3/4 (看更多)
不好意思 我可能沒有說清楚 現在是 如果有人丟了以下一串東西給我 MAAIASTLSLSSTKPQRLFDSSFHGSAISAAPISIGLKPRS FSVRATTAGYDLNAFTFDPIKESIVSREMTRRYMTDMITYAETDVVVVGAGSAGLSAAYEISKNPNVQVAIIEQSVSPGGGAWLGGQLFSAMIVRKPAH LFLDEIGVAYDEQDTYVVVKHAALFTSTIMSKLLARPNVKLFNAVAAEDLIVKGNRVGGVV TNWALVAQNHHTQSCMDPNVMEAKIVVSSCG HDGPFGATGVKRLKSIGM IDHVPGMKALDMNTAEDAIVRLTREVVPGM 像這種亂糟糟的感覺 而一般fasta格式通常是80或70個在一個column裡面 而我應該如何將上面這組東西變成標準的格式?? 希望有人可以分享經驗m(_ _)m -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 134.208.44.23
推
06/02 21:19, , 1F
這是一條序列還是多條序列?
06/02 21:19, 1F
→
06/02 21:24, , 2F
多條
06/02 21:24, 2F
→
06/02 21:24, , 3F
他們原本都是正式的fasta format 但是變成這副德行= =
06/02 21:24, 3F
→
06/02 21:33, , 4F
轉成fasta的目的是什麼阿...不然一般的程式直接把序列
06/02 21:33, 4F
→
06/02 21:34, , 5F
都進去都是可以支援的
06/02 21:34, 5F
推
06/02 22:39, , 6F
你這一串是真正有 ">" 開頭的 fasta 序列對吧?
06/02 22:39, 6F
推
06/02 22:40, , 7F
試試看板友建議的轉文工具..先把他轉成另一種，再轉回來
06/02 22:40, 7F
→
06/02 22:40, , 8F
搞不好這樣就整齊了..這樣最省事，再來就是自己寫程式
06/02 22:40, 8F
→
06/02 22:44, , 9F
不過就像 auymle 說的，應該也無所謂吧?
06/02 22:44, 9F
推
06/03 00:11, , 10F
能不能給你想要的output格式?這樣會比較清楚
06/03 00:11, 10F
推
06/03 06:39, , 11F
06/03 06:39, 11F
→
06/03 06:40, , 12F
各種格式都能轉
06/03 06:40, 12F
→
06/03 06:41, , 13F
不過話說回來,這種東西應該隨便google都找得到吧...
06/03 06:41, 13F
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