討論串[問題] Transcription Start Site
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之前auymle有提到 'ORF的起始位置不代表TSS, 所以ORF是用來預測可能的protein. coding region, 而不是用來預測TSS的' 我想這也就是我大部分文獻找TSS都用預測. Promoter來做 還有人想到可以用別的方法做嗎?. 另外我補充ㄧ下上述intron的問題 ha
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在此回覆一下huggie兄的問題 (另外有些是我們私下討論的 也一併寫上). huggie兄提到promoter region會不會包到intron呢?. 在以下情況是會的. 假設Gene A他有2種不同的transcripts I and II. I是由exon1轉錄而II是exon2轉錄. 那當
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其餘恕刪. 以我個人的經驗 以Ensembl API或Biomart(前面請大家搜AID的文章有題到). 從Ensembl database抓sequence時,TSS就那麼一個而己歐(TSS為0). 再往前推upstream為promoter region. 若有其他需求(例如考慮在不同trans
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