討論串[問題] 請問版上高手 蛋白質預測的問題
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如果您指的是蛋白質結構的話. '預測'這件事情是不大可能 現在能做到的就是'搜尋比對'出相似結構. 基本上相似的sequence比較容易有相似的structure(但也不是絕對). 不過相似的structure卻很常沒有相似的sequence. " During evolution, three-d
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其實也不是不太可能. 看你如何去用你所知的工具. 像在蛋白質結構預測的部份. 我們除了可利用區域比對的方式之外 還可以使用像是machine learning去做. 這部份的話在預測上可以達到80%以上的準確率. 它的原始概念類似. 假設今天某一條序列中的一個AA是某種結構，則在他附近的鄰居(AA)
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原文恕刪~~~. 我想我的疑問沒有被解答. 就直接回文來討論一下吧. 我這邊認為的蛋白質預測. 是指 丟入蛋白質的胺基酸序列給軟體. "預測"出他的"三級"結構. 那麼如果是一開始就有PDB檔 就代表他的結構已經被解出. 打開裡面就可以看到坐標. 丟到類似PYMOL 或是 CHIME 之類的軟體 即
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嗯~ 我可能講的不夠清楚. 其實這邊預測的的確確是可以做到給定一未知protein 然後預測出其二級結構. 我所提的方法只是所謂建立一個model. 而model的建立當然是由一個已知的資訊才能建立. 所謂用machine learing的方式是說. 我提供屬性及答案給機器讓他像人一樣去學習. 當學
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