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討論串[求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
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[轉錄][求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
推噓1(1推 0噓 2→)留言3則，0人參與, 最新作者huggie (huggie)時間16年前 (2008/06/17 20:59), 編輯資訊
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※ [本文轉錄自 Biotech 看板]. 作者: NightAmades (夜) 看板: Biotech. 標題: [求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?. 時間: Tue Jun 17 18:20:48 2008. 各位大大好!. 我送蛋白質樣本打LC/MS/MS. 而送樣回來的檔案經由
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#2
Re: [轉錄][求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者NightAmades (夜)時間16年前 (2008/06/18 19:02), 編輯資訊
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43.... ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^. 這我了解，可是不知道怎樣的機器設定又是怎樣會較合理!?. 例如中研院蛋白質體服務的機器，送樣回來是有建議設定的參數數值!. 可是根據在中研院內的工作人員說...其實所建議的參數也只是針對. 根據他們所跑的蛋白是經過純化且量多
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#3
Re: [轉錄][求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者muchmoa (...)時間16年前 (2008/06/20 11:10), 編輯資訊
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送到TPP的原因是因為他免費嗎？@@". 我知道如果有兩種以上軟體的結果互相對照會比較準確，. 但通常都不是免費的，. TPP這東西之前有看過介紹，似乎也是個要憑經驗的工具啊，. 可以麻煩大概介紹一下流程或使用經驗嗎？. 謝謝. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From:
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Re: [轉錄][求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
推噓2(2推 0噓 2→)留言4則，0人參與, 最新作者huggie (huggie)時間16年前 (2008/06/20 21:24), 編輯資訊
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我雖然身處 proteomics 實驗室，但很慚愧的現在才真正要接觸，所以還不是. 很了解。如果是銜接 Sequest，Sequest只負責 peptide assignment，但並沒. 有去評估 false positive。一個 peptide assignment 也許看起來很好，但. 也可
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