Re: [轉錄][求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
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: 第一 要看你用什麼機器(ms) 這很重要 因為每種機器的解析度 大不相同
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這我了解，可是不知道怎樣的機器設定又是怎樣會較合理!?
例如中研院蛋白質體服務的機器，送樣回來是有建議設定的參數數值!
可是根據在中研院內的工作人員說...其實所建議的參數也只是針對
根據他們所跑的蛋白是經過純化且量多的情況而設定的!因此這顯然並不是
一個大家通用的好的參數設定!(個人認為啦~"~)
: 會跟你要設定的tol有關係 當然ms1 tol and ms2 tol會不一樣? 這是合理的
: 可參考http://www.matrixscience.com/help/search_field_help.html#TOL
: 第二 不要選錯db 不然沒有意義
: 第三 基本的ptm 要設好例如最基本的 C,M上面的修飾
: 第四 只有看到mascot上面的結果是不夠的 建議將結果轉出來 送到
: CPAS https://www.labkey.org/project/home/begin.view
: TPP http://tools.proteomecenter.org/TPP.php
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不好意思太孤陋寡聞了~"~ 由於沒有用過這兩個，可否簡單解釋一下
這程式or軟體是用來做什麼的?什麼時候很需要用到它?若不是用它
而只是用下述所謂的Excel或人工自己分析...用word統整有何優缺點之處!?
而所謂的"整合"是指什麼 @"@??
感激不盡!^^
: 去整合 可能會更方便
: ps最近看到其他學校的學生還在用excel去做蛋白質體的分析 無言!!
: 台灣人要加油了
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※ 編輯: NightAmades 來自: 140.127.160.142 (06/18 19:10)
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