Re: [轉錄][求救] MASCOT蛋白質身分鑑定參數設定?
※ 引述《muchmoa (...)》之銘言：
: 送到TPP的原因是因為他免費嗎？@@"
: 我知道如果有兩種以上軟體的結果互相對照會比較準確，
: 但通常都不是免費的，
: TPP這東西之前有看過介紹，似乎也是個要憑經驗的工具啊，
: 可以麻煩大概介紹一下流程或使用經驗嗎？
: 謝謝
我雖然身處 proteomics 實驗室，但很慚愧的現在才真正要接觸，所以還不是
很了解。如果是銜接 Sequest，Sequest只負責 peptide assignment，但並沒
有去評估 false positive。一個 peptide assignment 也許看起來很好，但
也可能就是隨機就很可能發生的 match，因此TPP就是用統計方法評估。 TPP
分 peptide prophet 跟 protein prophet 部份，細節還不了解。我只知道
peptide prophet 會評估 peptide assignmen 的可能性，然後 protein
prophet 會看一個 protein 有多少 peptide 被偵測到，然後去評估這個
protein 實際上出現的機會。
至於可以提供 Mascot 結果什麼樣子的幫助就不是很了解了。
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