[問題] 關於linkage diseqilibrium(LD)方面的問題
我想請問的是關於:
1 計算|iHS|的原理或是方法
2 計算EHH的原理或方法
我最近在看一篇期刊來自nature vol 419, 24 october, 2002
《Detecting recent positive selection
in the human genome from haplotype structure》
iHS(integrated haplotype score)
據說用這個判斷只要|iHS| >2的都會被認為有positive selection;
EHH是說能夠看在core haplotype旁邊的allel,
用一種機率方式的分布方式描述這個allel的聯會程度。
意義方面我也只是含糊瞭解,也找不到計算的敘述。
想請問看看是否有高手能夠指示一下,不一定要教我,
有這方面計算的文獻都可以。
可以寄信到這個b信,
或是sky721209@yahoo.com.tw,
或是直接回文都無妨,感激不盡。
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
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