[問題] 關於siRNA的序列以及在mRNA上結合位置

看板Biology (生物學)作者 (...)時間18年前 (2008/05/21 19:10), 編輯推噓0(000)
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【問題】: 1. 請問一下在siRNA中,對於mRNA上的target site是否有所偏好呢? 我知道miRNA的作用位置是在3'-UTR上,不知道siRNA的情況是? 2. siRNA的序列組成是否有某種規律在? PAZ domain是否會傾向與特定 序列結合呢? 目前只知道需要3'端的2個鹼基的overhang 【問題起因】: 大學快畢業了,開始亂看paper而想了解的地方 【個人看法】: 1. 我覺得siRNA與mRNA上的protein coding sequence做結合的話,silence 的效果應該會比較好吧,不知道實際情況是? 2. 有paper說3'overhang跟blunt end的2個鹼基如果是 (CA) (GA) (UA) Dicer在作用上比較有效率,不知道是否可以作為在設計shRNA時的一個篩選標準呢? 希望版友解開我的疑惑~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.127.70.237 ※ 編輯: sheepfeather 來自: 140.127.70.237 (05/21 19:15)
文章代碼(AID): #18D0CGCS (Biology)
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