Re: [問題] 請問DNA纏繞histone是左旋還右旋?
※ 引述《rtyr (美嘉)》之銘言:
: 【問題】:如題
: 【問題起因:生化課程
: 【個人看法】:老師上課有兩頁ppt都說到DNA纏繞histone
: 一邊是寫左旋,但另一邊卻是寫負超螺旋,但負超螺旋不是右旋嗎?
: 到底是哪一個啊??
左旋(left-handed)與右旋(right-handed)
和正 負超螺旋(positive-/negative-supercoiled) 的概念是不一樣的
用簡單的方式講
當你在看一個雙股DNA兩條strand怎麼繞時
可以叫它站直 然後把兩隻手拿出來:
大拇指朝著旋轉前進的方向(上/下) 其餘四指轉的方向就是旋轉的方向(順/逆時針)
ex:一般的B-DNA是右旋
而超螺旋的概念比較難單純用文字解釋
基本上以原始鬆弛狀態的DNA做基準
DNA兩股纏得更緊是positive, 更鬆就是negative-supercoil
可以想像成橡皮筋啊
如果把橡皮筋切開 用手固定住兩端一直朝同個方向扭(變緊) 會跑出一個環吧
這種loop是因為橡皮筋緊繃的關係 要抵銷掉原本的扭力而產生的
看它鬆緊的程度決定會有幾個圈圈出現
真是抽象啊
總而言之你在看到這樣的loop時 不能用左/右旋的觀念帶入
p.s.其實有一種數學公式解釋啦: L=W+T (加上delta也可)
但是這實在太天書了 有興趣再研究~
所以廢話那麼多 核小體上纏繞的DNA是negative-supercoiled
你的老師說是左旋應該不是前述看兩條DNA strands內部
是把整條DNA當一條繩子 看它進出纏繞的方向吧
p.s.我覺得用negative supercoil表示比較好啦
可以表示histone和DNA的結合有特定位置(有作用力) 而非單純把一條繩子繞在一顆球上
所以要我看Lehninger和Genes IX好像都是這樣寫
文字或許不太能達意的地方 就參考書本的圖吧~
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| 沒看過上吊自殺啊!? | | |再不走開
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