Re: [問題] 請問基因圖譜如何定序
※ 引述《kuogary1 (桂冠)》之銘言:
: 標題: [問題] 請問基因圖譜如何定序
: 時間: Fri Jun 25 22:17:06 2010
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: 【問題】:基因圖譜如何定序
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: 【問題起因】:書上寫說,先把DNA解開,然後加入dATP, dGTP, dCTP, dTTP與引子
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: 接著再把它們混合後分到四個試管,四個試管分別加入ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP
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: 然後開始反應
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: 反應完成後跑電泳讀譜
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: 【個人看法】:可是DNA不是由互補的兩股組成嗎?
: 這樣直接把DNA解開去跑電泳,得到的結果怎麼有辦法代表DNA序列?
: 應該是要先把兩股分離開來吧?再挑一股來跑吧
: ===
: 先感恩各位大大的回答了^^
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: 飢餓是最好的調味 孤獨是最強的催眠 瘋狂找一雙唇 能夠當我酒杯
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: 早就對這一切厭倦 也曾憤怒喝下聖水 卻又無助醒在 下個漫長黑夜
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: ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
: ◆ From: 112.104.158.145
: → turtle24:"引子"設計成只認其中一股 06/25 22:26
: 喔喔喔~暸解
: 那所以,如果像是一般細胞中DNA的複製
: 那個DNA複製就是有兩組RNA引子從兩頭進行嗎?
: 以及,如果這樣,那PCR中的引子,是不是都需要特別挑過...
: 不是所有想放大的DNA都能使用?
: ※ 編輯: kuogary1 來自: 112.104.158.145 (06/25 22:32)
in vivo的DNA replication從由特殊序列所構成的origin開始
通常在原核內origin只有一個 然後是bidirectional (因為是環狀DNA)
真核的話就相當多個 不然複製完都中秋節了
然後"基因圖譜"的定序方式通常是會先將DNA打碎之後ligate到固定序列的aptemer
或是linker上
在看要clone進vector裡面再進行sanger法定序或是直接上第二代定序機
aptamer跟linker的序列就是universal的primer序列
這些在一般遺傳學跟分生課本裡講的都很清楚可以自己參考看看
還有沒錯 幾乎每間實驗室都花不少錢在化學合成的primer上面
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人好 欠表
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◆ From: 118.165.225.252
※ 編輯: Ianthegood 來自: 118.165.225.252 (06/25 23:40)
推
06/26 00:39, , 1F
06/26 00:39, 1F
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