Fw: [推薦] Cellprofiler-強大的科學影像分析軟體

看板Biology (生物學)作者 (科羅拉多的豪邁)時間14年前 (2012/01/06 16:25), 編輯推噓1(100)
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※ [本文轉錄自 EZsoft 看板 #1F1b7x72 ] 作者: jimmy0930 (小蘇) 看板: EZsoft 標題: [推薦] Cellprofiler-強大的科學影像分析軟體 時間: Fri Jan 6 09:44:22 2012 軟體名稱: CellProfiler 軟體資訊: 英文/xp~Win7/Mac/Linux 軟體功能: 科學影像分析用,可以幫你算細胞,或是某個螢光染色的強度等等 軟體特色: 可分析像是 Arrayscan 掃出來的圖,能修改的細節相當多 可搭配 CellProfiler Analyst 作一些 Data 的分析與瀏覽 (CellProfiler Analyst 也是免費) 官方網站: http://www.cellprofiler.org/ 下載連結: CellProfiler: http://www.cellprofiler.org/download.shtml CellProfiler Analyst: http://www.cellprofiler.org/downloadCPA.shtml 推薦原因: 可以批次處理一堆圖 (圖檔有命名原則就好) 重點是免費呀,同性質的付費軟體都要將近百萬上下 另外似乎可以搭配資料庫使用 (這個找時間再來研究 XD) 誰適合用: 需要科學影像分析的人 誰不適合用: 排斥英文,懶得花時間研究此軟體的人 使用感想: 只有讚而已 可以把你要的步驟 (包括影像的前處理) 全部寫在一個 pipline 裡 可針對特定的實驗寫特定的 pipline 網站上也有許多實例可以下載參考 本著作依據 Creative Commons 姓名標示-非商業性-相同方式分享 授權條款為授權 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/tw/ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.235.155

01/06 12:07, , 1F
感覺就是個專業軟體XD
01/06 12:07, 1F

01/06 15:37, , 2F
跟ImageJ比起來如何? 借問一下是否可轉生物版?
01/06 15:37, 2F

01/06 16:19, , 3F
CellProfiler 比較偏向 high throughput 的實驗使用
01/06 16:19, 3F
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ※ 轉錄者: vixen (71.218.232.126), 時間: 01/06/2012 16:25:58

02/11 20:58, , 4F
有下有推 感謝分享
02/11 20:58, 4F
文章代碼(AID): #1F1h0Nuq (Biology)
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