[問題] 關於整個qPCR的trouble shooting

看板Biology (生物學)作者 (夢夢夢夢想家)時間10年前 (2015/05/16 11:09), 編輯推噓1(100)
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【問題】:從細胞中取RNA到轉成cDNA到最後跑qPCR可能出問題的步驟和確認方法 【問題起因】:1.qPCR出來的結果不太正常,要如何學習去找出問題的根源 首先 取RNA時 要先確保RNA不會被降解 過程中的小細節不提 取完之後到跑qPCR之間 有哪些方法可以知道自己取出來的RNA有沒有 問題呢? 2.用kit(invitrogen)取出的RNA 280/260的值很好(~2.0) 可是260/230卻很糟 (~0.5)過程我也沒用有機溶劑 用kit的可以用酒精洗嗎? 【個人看法】:取完之後先用nanodrop看 280/260 和 260/230的 O.D.值 但是就算O.D.值沒有問題 RNA有可能斷成小片段而不知道 導致最後qPCR的結果不好 (melting curve沒問題) 因此中間可能要用跑膠的方法去確認RNA的完整性 但是我大學科系 非生科背景 原理懵懵懂懂 不知道跑膠該設那些組別來跑 跑cDNA和跑RNA各有那些優缺點也不知道 學長姊也都非生物背景 大致上都不知道 (是生物背景的也沒做PCR) 可以請各位給些建議看的書籍和一些建議嗎? 謝謝!!! 【參考資料/連結】: -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.113.136.221 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biology/M.1431745750.A.943.htmlbaal90317:轉錄至看板 Biotech 05/16 11:10

05/26 06:03, , 1F
260/230 0.5也太髒= =用酒精喜到1.3以上吧
05/26 06:03, 1F
文章代碼(AID): #1LLhJMb3 (Biology)
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