Re: [問題] 有關序列分析, 要用到生資概念......
※ 引述《malate.bbs@ptt.cc (陶波湖上舞煙波)》之銘言：
> ※ 引述《malate (陶波湖上舞煙波)》之銘言：
> : 我手上有一個基因完整的蛋白質序列
> : 其中有幾個胺基酸構成一個motif
> : 此種motif在這一個片段中重複了數次
> : 我想找其他生物的各類基因中是否也有此類似的情況發生(motif序列相似的情況下)
> : 各位大大知道有哪幾個平台可以做這樣的分析嗎
> 有試過
> 找出相似基因後
> 想看這些基因中是否也有相似的片段且重複出現
> 但相似度最高才60幾 且只出現在一個位置
> 這樣是沒結果 還是我用錯方法了
> 還有
> 謝謝大家幫我解答 感激不盡~~
推薦一種方法....
自己寫程式抓出所有含有該motif
用程式語言Perl
安裝PERL 免錢
參考書 Begining Perl for Bioinformatics갊躨ケ茖潃禮拜ꔊi以自己寫程式抓出所有含有該motif 之蛋白質
更快的方法:
找個做生資的人幫你寫程式
不用幾個小時
--
◤◥ Origin: 中央生科˙生生不息 nculs.twbbs.org.tw
◣◢ Author: ubiquitin 從 leu.ibms.sinica.edu.tw 發表
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