[問題] 請各位大大幫忙

看板Biotech (生命科學)作者 (~我們就是有分別)時間19年前 (2006/10/04 00:38), 編輯推噓4(403)
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請問在PCR的分析方法中 跑gel 時看到的結果是有自己的product, 但也出現primer dimer的情況 嘗試過以2倍2倍dilute primer來做, 如5uM, 2.5uM, 1.25uM....... 發現自己的product和primer dimer的強度也隨著primer concentration的下降而變弱 那請問要如何改善才可解決primer dimer的問題呢 是否增加annealing temperature 會增加affinity而減少這樣的情況 或是延長denature temperature 的時間會不會有幫助呢 以上是我想到的方法 因為primer dimer 會影響定量 我們老師不接受這樣的data 我正在煩惱中 請各位強者可以提供我一點點的意見 感激不盡~~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.74.69

10/04 01:56, , 1F
redesign primer
10/04 01:56, 1F

10/04 09:21, , 2F
提高annealing temperature,或用gradient PCR抓條件
10/04 09:21, 2F

10/04 14:27, , 3F
減少cycle數試試
10/04 14:27, 3F

10/04 21:31, , 4F
可以加DMSO!(破壞hydrophobic interaction)不過建議1F作
10/04 21:31, 4F

10/04 21:32, , 5F
的作法!!重新設計比較不浪費時間.建議你PO出條件.
10/04 21:32, 5F

10/05 00:32, , 6F
因為是在抓條件,所以在95-30s,53-30s,72-30s,40cycle
10/05 00:32, 6F

10/05 12:27, , 7F
除分primer Tm低,不然53可以再提高些
10/05 12:27, 7F
文章代碼(AID): #158f86FB (Biotech)
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