Re: [問題] 請問質譜儀如何訂出蛋白質序列?

看板Biotech (生命科學)作者 (畢業V.S失業)時間19年前 (2007/04/28 21:50), 編輯推噓4(404)
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※ 引述《untilnow (炸~豬排)》之銘言: : ※ 引述《mason (錯愕...渺小...)》之銘言: : : 請問質譜儀如MS/MS, 如 ESI-Q-TOF 是怎嚜訂出蛋白質序列的@@? : : 可以解釋ㄧ下嗎? : : 先在應該沒有人在用sanger method 了吧@@>? : : 謝謝^^ 好比說 一個protein MW=5000 經過質譜能量的提供會將a.a. 打斷 而可以看到 斷一個aa.的分子量 譬如說4911 打斷兩個變成4778 所以會在質譜圖上看到 斷不同數量的a.a.後的分子量訊號 在將兩根訊號相扣得到單一個的a.a的序列 以上述的例子就是 (5000-4911=89, Ala), (4911-4778=133, Asp) 這樣拼拼湊起結果~ 有了解到吧~~!!所以 可以得到protein seq. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 220.139.45.168

04/29 13:40, , 1F
有點類似Edman Degradation,但質譜的斷法好像是片段化@@>?
04/29 13:40, 1F

04/29 17:05, , 2F
MW 5000 會再使用TRYPSIN等酵素切成小塊
04/29 17:05, 2F

05/01 00:58, , 3F
是利用Data base 來比對已知質譜圖嗎??
05/01 00:58, 3F

05/01 11:03, , 4F
應該說,利用不止一種酵素分別切成小段,來確任每一小段
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的蛋白質序列,及每小段的排列方式 (因為不是每個點
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的斷裂機率都一樣)
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對己知蛋白,trypsinize後的PATTEN可以向DATABASE比對
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05/01 11:06, , 8F
但未知蛋白也可以使用它來定序
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文章代碼(AID): #16Cr4SzU (Biotech)
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