Re: 請問screen DNA-binding protein的方法?
看板Biotech (生命科學)作者aggaci (reject！又reject！)時間19年前 (2007/06/14 22:19)推噓0(0推 0噓 0→)留言0則, 0人參與討論串2/2 (看更多)
※ 引述《pneumonia.bbs@beta.life.nthu.edu.tw (JUAN)》之銘言：
: ※ 引述《AnalogSet.bbs@ptt.cc (類比設置)》之銘言：
: > 我現在已經有一段potential promoter region
: > 接著要找會bind這段region的transcriptional factor
: > 請問有什麼方法可以用呢?
: > 可以用EMSA去跑 (nuclear extract + DNA fragment)
: > 然後再把會binding的shft band挖下來 純化 然後去打mass嗎?
: 理論是可行的
: 實際上有點辛苦
: 因為這麼做的蛋白質的量實在很少
: 每次ID都找到keratin
: 就算找到一個TF
: 是不是真的 也要大費周章去確認
: 你最好現在是博一….
理論上可行，但是有困難
倒不如跑DAPA再鑑定，這樣還是很麻煩
最好的方法是先predict可能是哪些TF再用競爭的實驗驗證
最後用抗體去做supershift...運氣好的話很快就有結果
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.114.100.165
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