[問題] real time RT PCR primer design?

看板Biotech (生命科學)作者 (白衣天使黑心肝)時間18年前 (2007/08/09 18:47), 編輯推噓2(203)
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請問 本實驗室要進行real-time RT PCR 目前實驗設計卡在primer的設計 因為mRNA萃取出後要轉成first strand DNA 接著cDNA為樣本進行real time RT PCR 在primer的設計上照理來說應該以cDNA為模版來設計 但cDNA為單股 其核甘酸序列與mRNA互補(應該對吧?) 故在設計時應以DNA的template strand來設計 這樣想法對嗎? 若database所搜尋出的其DNA序列為 ATGAAAGTGATGA.........................TTCCGCAGGTAGCACTGTG 在設計時primer-f應為5'-ATGAAAGTGATG-3' primer-r應為5'-CACAGTGCTCCT-3' 在不考慮dimer或aneling temperature之下這想法對嗎? 感謝版上先進回答 ※ 編輯: belady 來自: 140.128.151.223 (08/09 18:51)

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別想太複雜.就是你要夾出的片斷+5`=>3`原則就好了..正確
08/10 01:50, 1F

08/12 23:49, , 2F
通常找出來的都是mRNA序列吧..用mRNA序列就可以設計了
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08/12 23:49, , 3F
記得要跨exon..所以應該要找mRNA序列..
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08/12 23:50, , 4F
你用mRNA設計出來的primer也一樣可黏上cDNA啊
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08/12 23:50, , 5F
有回答到你的問題嗎?
08/12 23:50, 5F
文章代碼(AID): #16kl32eQ (Biotech)
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