[問題] real time RT PCR primer design?
請問
本實驗室要進行real-time RT PCR
目前實驗設計卡在primer的設計
因為mRNA萃取出後要轉成first strand DNA
接著cDNA為樣本進行real time RT PCR
在primer的設計上照理來說應該以cDNA為模版來設計
但cDNA為單股 其核甘酸序列與mRNA互補(應該對吧?)
故在設計時應以DNA的template strand來設計
這樣想法對嗎?
若database所搜尋出的其DNA序列為
ATGAAAGTGATGA.........................TTCCGCAGGTAGCACTGTG
在設計時primer-f應為5'-ATGAAAGTGATG-3'
primer-r應為5'-CACAGTGCTCCT-3'
在不考慮dimer或aneling temperature之下這想法對嗎?
感謝版上先進回答
※ 編輯: belady 來自: 140.128.151.223 (08/09 18:51)
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