[求救] 有關蛋白degrade

看板Biotech (生命科學)作者 (忘了該怎麼休息。)時間18年前 (2008/01/24 21:50), 編輯推噓6(6016)
留言22則, 6人參與, 最新討論串1/1
小弟最近在做一個蛋白 我做的蛋白有接GST 是用 pGEX-4T-1 vector 表現 用的菌是BL21(DE3) 經過純化的結果 我發現我這個蛋白degrade超嚴重 至少有50% 以上 可能到70~80% 都degrade掉了 本來在37度養到O.D 600 > 1.0, 在25度 induction,IPTG濃度 1mM 後來我有做不同induction的時間 其實和一般protocol差不多 在三小時後就會有蛋白表現 只是 它瘋狂degrade 現在是在25度養 18度induction 這樣做似乎沒有改善太多 所以想請教各位大大 有沒有人做過蛋白也會degrade的 是怎麼解決的 我目前能想到的就是應該換其它的strain 來表現? 有人知道有什麼strain可以表現這種難搞的蛋白嗎? 或是 再改溫度、IPTG濃度? 還是遇到這種情形只能硬做? @@" 我只是想參考下有經驗的人 解決的方法 謝謝各位了~~~~~ -- ▃▄▅▄▃ ╔╮╔══╮╔╮╦╮═╦ ██████ ╰╝╠══╣║║║║╔║ █▆▇█▆▇ ╔╭╰══╝║║║╜║║ █████╰╣╖╮╖╮║║║║║║ ██████ ╭╣╠╛╠╛║║║║╰║ ██████ ╚╯╰╜╙╯╰╝╜╯╰╝ ξviolescent -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.192.246.24

01/24 22:35, , 1F
請教一下蛋白純化的步驟,可能是這裡導致蛋白降解嚴重...
01/24 22:35, 1F

01/24 22:50, , 2F
基本上破菌完就很明顯可公看到degrade那幾條band了
01/24 22:50, 2F

01/24 22:51, , 3F
我有加protease inhibitor
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01/24 22:53, , 4F
和一般GST純化的protocol差不多,破菌完和beads先
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binding 之後用PBS wash之後用10mM Glutathione, 50
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01/24 22:54, , 6F
mM Tris-Cl, pH 8.0 去elute
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01/24 22:56, , 7F
全程都在cool room
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01/24 23:33, , 8F
有試過提高inhibitor的濃度嗎,或是換個inhibitor?
01/24 23:33, 8F

01/25 00:28, , 9F
Try to use His-tag for protein purification !!
01/25 00:28, 9F

01/25 00:34, , 10F
嗯... 我是利用細菌來進行sumoylation 在sumo上有接
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01/25 00:35, , 11F
His-tag
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01/25 00:36, , 12F
也就是說我的E.coli裡有二個plasmid
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01/25 00:37, , 13F
所以 可能換其它的tag試試看嗎? 不要用GST嗎?
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01/25 00:39, , 14F
所以蛋白degrade成這樣 是GST-tag 的關係?
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01/25 00:51, , 15F
我當時有做過GST接一個membrane protease蛋白..也是會
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生些許的degrade..所以有部份是蛋白的本身特性..
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如果沒有inclusion body 或產量的問題...His 是一個
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01/25 00:56, , 18F
比較好的選擇..另外也有可能是GST跟protein之間的link
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01/25 00:58, , 19F
的sequence剛好不太適合你..
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01/25 00:59, , 20F
好像一般GST是接N端..如果沒辦法的話接C端呢?
01/25 00:59, 20F

01/25 12:24, , 21F
如果換成protease free的Host呢?
01/25 12:24, 21F

01/26 10:00, , 22F
和樓上學長的意見一樣 換一個菌種看看~~~
01/26 10:00, 22F
文章代碼(AID): #17c9UOtk (Biotech)
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