[求救] pine tree 抽RNA時,出現無法分層的狀況

看板Biotech (生命科學)作者 (年光)時間17年前 (2008/09/08 22:13), 編輯推噓2(204)
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如題 抽RNA的對象,是阿拉伯芥的葉子混合果莢、種子及花 共 0.1g 為了怕多醣干擾的問題,所以用了pine tree的方法 過程是:液態氮冷凍--->用extraction buffer + beta mercaptoethanol混合磨碎組織 --->攝氏65度加熱五分鐘---->加24:1 的chloroform:isoamyl alcohol(CI)--->離心,吸 上清液,並重複加入CI並離心的步驟直到介面澄清 在第一次加入CI並離心後,上下兩層有明顯的分界,其間隔著很厚的一層植物的殘渣及 雜質 但在第二次加入CI再離心後,分界就不明顯了,而且離心更久也無用。靜置一段時間後 可看到模糊的分界,但是一離心又不見了 原本想說會不會是CI有問題導致無法分層,所以分別用了清水和extraction buffer加 CI,結果都有明顯的分界 想問問板上的各位大大,是否曾在做pine tree 時遇到相同的問題呢?到底是為什麼 呢? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.60.42

09/08 23:03, , 1F
抽RNA的CI應該是用49:1~
09/08 23:03, 1F

09/08 23:04, , 2F
我也是用pine tree的方法抽果實~CI是用49:1
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09/08 23:08, , 3F
這是我們修正過CI後的結果~~呵...剛剛忘了說!!
09/08 23:08, 3F

09/09 15:33, , 4F
感謝d大的回答! 我會試試看的
09/09 15:33, 4F

09/09 16:39, , 5F
只是,想再問一下,為何是調整CI呢?
09/09 16:39, 5F

09/10 08:47, , 6F
buffer VS sample至少要3:1 至少喔~!
09/10 08:47, 6F
文章代碼(AID): #18nJCaUO (Biotech)
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