[求救] southern的問題
請教版上各位前輩
我正在做southern 測定mouse的DNA片段
可是效果一直很差 很不穩定
有時酵素切不動 雜交也不完全
每次做的結果都不大相同 = =a
以下是實驗步驟和條件
切酵素:
total :200 ul
DNA:5 ug (大約7 ul)
酵素:分別是 EcoRI HindIII BanHI 分三管各2ul
bfr:20 ul
作用溫度:37度
時間:18~24小時
有時候切的動 有時切不動...
之後會用isopropanal 和70% 酒精 沉澱純化 回溶在15 ul的2D水
步驟:
1.加入3M NaoAc 10 ul及ice isopropanal 200 ul
2.置於-80度 20min
3.4度C 高速離心 15min後去除上清液
4.加入70%酒精 200 ul 輕輕搖晃30次左右
5.4度C高速離心 15min 去上清液
6. air-dry後溶於2D水
純化後都有跑膠測試,看起來都沒問題
之後就直接跑大片膠轉膜了(用的是Assembling the Transfer unit,用抽氣機)
雜交是用Roche的Kit
請問...這樣看的出有什麼問題嗎?
個人認為 酵素切不動是不是總體積太小?
還有...有什麼因素會影響到雜交呢?(除了溫度以外)
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.130.98.90
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