Re: [求救] real time PCR primer設計
※ 引述《midnight4 (midnight)》之銘言：
: 借標題問一下
: 一般大家都是設計跨intron的primer
避免Genomic DNA contamination
: 但是好像很少會考慮primer dimer造成的影響
: 是為什麼呢？
Syber Green 要考慮 primer dimer
Hydrolysis probe (Roche UPL)不用
很貴的Taqman不用設計也不用
原因起參考其原理不同
: 常常為了跨intron因此怎麼調都有hairpin or primer dimer...
: 另外有些基因他的intron很少或是剛好都在5'端
: 這樣大家還會去設計跨intron的primer嗎？
能設計就設計
不能設計 就操作時避免genomic DNA contamination可能性
順便附上兩個網站 是設計primer的
Roche UPL (Roche hydrolysis probe用) 可能會有primer dimer
http://ppt.cc/PsRo
Primer bank (For SyberGreen system)
http://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/
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本人是個死孩子 還沒用過syber green system （欠打）
但是 有老師說上面這個primer 大約有90％可以for SyberGreen
就參考看看囉！
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 123.193.73.119
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