[求救] 有關於定序的問題,為什麼會這樣..

看板Biotech (生命科學)作者 (松鼠)時間14年前 (2011/07/25 17:38), 編輯推噓2(202)
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由於我們是在做基因突變的篩檢,因此定序結果是我們判讀是否突變 或是heterozygous的主要方式。而最近發生了一個問題,特定兩個exon中 的特定一兩個位置,讀正向時每次都會出現heterozygous的pick,也就是 同一個位置有兩個pick,但是讀反向時就沒有出現,只有那兩個點有出現這 種情況。此外定序的雜訊很少,因此認為可能不是雜訊的問題。即使是不同 人的DNA都有這種情況發生,而且都是在相同的位置上產生。後來我將PCR體積 從25ul改成20ul後,好像就沒有這個問題發生了,是因為primer,DNA濃度?? 原因為何好像還是無解,想知道大家有什麼想法。 附上定序的圖正向及反向http://imgur.com/ZXXIu
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07/25 20:22, , 1F
*peak
07/25 20:22, 1F

07/26 23:40, , 2F
正反向定序本來就會有差 會有這種情況是PCR條件沒抓好
07/26 23:40, 2F

07/26 23:41, , 3F
調整溫度 鎂離子 各種可能都可以改善
07/26 23:41, 3F

07/30 22:10, , 4F
感謝~~
07/30 22:10, 4F
文章代碼(AID): #1EBJcMvm (Biotech)
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