[問題] real-time pcr

看板Biotech (生命科學)作者 (西恩)時間14年前 (2011/08/10 22:22), 編輯推噓5(5011)
留言16則, 7人參與, 最新討論串1/1
新手上路看了一下原理想問 real-time PCR只要看melting curve就可知道P出來的產物有沒有單一 為什麼不用再跑膠確認長度呢? 難道不會有單一melting curve 但卻P出不是預期的產物嗎??? (如primer夾出來的單一產物 長度(序列)不是我們要的) 還有real-time PCR的好處 是不是就只在於可以隨時監測PCR產物量的多寡 還是還有其他的好處@@? 像一般PCR 直接訂個30 cycle之類 丟在那邊就跑去做其他事 得到的結果不是一樣嗎? 反正PCR不是只是要放大片段 確認此序列的存在??? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)

08/10 23:49, , 1F
誰說不用跑的? 有人甚至還拿去定序哩 不用每次跑是真的
08/10 23:49, 1F
呃... 學長說real time都是用量化數據來判斷@@ 像是melting curve 所以不跑電泳 但不解的是不跑電泳怎麼知道擴出來的長度符合期望呢? (結果他也不知道 就說反正看melting curve有單一產物就好) 像一般的PCR不都是跑出來長度以後 再拿去定序

08/11 00:27, , 2F
不一樣吧 有不是每個sample丟30 cycle就解決了
08/11 00:27, 2F
對 我的意思是 目的是要放大片段 有必要隨時監控產量嗎?

08/11 08:25, , 3F
如果產物很多,在30 cycle前就飽和,你要怎麼判斷誰多誰少?
08/11 08:25, 3F

08/11 08:30, , 4F
如果是要做定量的話,real-time PCR就非常重要了
08/11 08:30, 4F

08/11 08:30, , 5F
但如果只是要看有/沒有表現的話,那一般PCR就夠了
08/11 08:30, 5F
原來如此 就是說有些實驗定量很重要...感謝解答~

08/11 09:58, , 6F
我以前跑完realtime都會跑膠看看...
08/11 09:58, 6F
所以realtime也是跟普通PCR一樣 無法確認產物內容@@?

08/11 14:47, , 7F
realtime不是拿來看有沒有的
08/11 14:47, 7F

08/11 14:48, , 8F
primer跟program都會先設計過 目的就是在定量
08/11 14:48, 8F
嗯 所以就是注重在過程 但最後不用確認序列(定序)嗎@.@? 就好像我們用普通的PCR 有時候雖然跑出預期長度 但最後送去定序結果沒夾到預期的序列 ※ 編輯: shienn 來自: 140.112.52.225 (08/11 16:34)

08/11 17:02, , 9F
主要就是soom版友說的那樣 爆表的話大家看起來沒差異
08/11 17:02, 9F

08/11 17:51, , 10F
就說realtime的primer都要設計成很專一 不會夾到別的
08/11 17:51, 10F

08/11 17:52, , 11F
東西 不會有其他band這樣
08/11 17:52, 11F

08/18 14:32, , 12F
melting curve可以看出專一性,但一般比較仔細的實驗跑完
08/18 14:32, 12F

08/18 14:33, , 13F
real-time之 後會跑膠與之對照,就可以排除你的問題所在
08/18 14:33, 13F

08/20 12:25, , 14F
你應該先去了解為什麼要做 real time PCR
08/20 12:25, 14F

08/20 12:25, , 15F
還有什麼是 real time PCR
08/20 12:25, 15F

08/20 12:26, , 16F
看你的問題就知道你對基本的原理不清楚
08/20 12:26, 16F
文章代碼(AID): #1EGfGvld (Biotech)
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