[求救] 請問如何找出各種物種的Highly conserved sequence ?

看板Biotech (生命科學)作者 (Wengda)時間14年前 (2011/09/15 22:32), 編輯推噓3(301)
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請問 我現在如果找到一個突變點 我們教授說要像有些Paper一樣 比較這個點 在各物種間是否具有高度保留的情況 如果有的話 代表 如果發生突變就會導致比較嚴重的情況 可是他也沒告訴我 如何找出來所有物種 我有到UCSC網站找到幾個 不過我只找的到他排出來的5-6種 不過我們老師 要至少10幾種 -.- ?? 他說不夠不夠 ....... 請問要怎樣找到各物種的序列並且像paper一樣排列出來 ?? 我有想過用BLAST = =? 是這樣嗎 ?? -- 我愛妳 用生命的愛 ~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.64.76.142

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NCBI,BLAST,出來的序列可以自己下載再用軟體排 / \
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09/16 10:10, , 2F
ensembl也有
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09/16 14:31, , 3F
你需要的是找到所有的物種然後再clustalW排一起
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09/17 18:35, , 4F
推captdavince的方法
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文章代碼(AID): #1ESWnqaP (Biotech)
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