[求救] miRNA PCR偵測方法

看板Biotech (生命科學)作者 (Shiuan )時間11年前 (2014/04/18 10:20), 編輯推噓1(101)
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各位前輩好 最近在測試一家ribobio的miRNA primer set 不知道有沒有用過他們家產品的前輩們可以給我一些建議 他們家的產品是利用有特異性的loop去轉出特定的miRNA,所以是用他們家的RT Primer ,然後RT enzyme哪家都可以,只是有溫度要求,要42度下去跑, 其他條件照平常做一般mRNA就可以了 (所以在這邊條件下我是用Roche one-step RT enzyme) 溫度就設42度60 min 72度10min, 4度3min) 然後Q-pcr的要求就都比照一般mRNA,只是F,R primer就是他們的primer set附得 我的SYBR是ABI的, QPCR機器是ABI 7300, 溫度條件照ribobio建議設 (1X)95 20sec (40X)95°C 10sec, 60°C 20sec, 70°C 10 sec. (在70度這邊因為儀器讀取時間10秒讀不到,所以我加到30sec) Add dissociation curve. Data collection at 70°C. 在以上的條件下,幾乎測不到數據,dissociation curve看起來是 一條抖來抖去的下坡... 因為已經買了好幾個miRNA的primer set,所以勢必是要把方法建立起來了 不然之前實驗室試用qiagen的,雖然很貴,但還滿好測的QQ 請問有沒有用ribobio的前輩們可以指導一下,看是要怎麼改條件會比較好,謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 61.230.207.49 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1397787648.A.EBD.html

04/20 00:39, , 1F
沒用過 但是 如果是hairpin loop RT溫度可以加個16~25C
04/20 00:39, 1F

04/20 00:40, , 2F
理論上RT hairpin loop本身能match的base 很少 所以要低溫
04/20 00:40, 2F
文章代碼(AID): #1JK8m0wz (Biotech)
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