[討論] protein-protein interaction研究方法
各位版友大家好,想請教一個關於研究protein-protein interaction的想法。
我的疑問是這樣的,我推測A protein是一個hydroxylase,
然後我想知道A protein是否與EGFR相互結合(目前尚不論A是否hydroxylate EGFR),
當然,最一開始的想法就是用IP來證明。
但從我的實驗結果,我並沒有看到A與EGFR的direct interaction,
反倒是當我用mutant A protein(將活性部位突變,使其失去活性)時,
才看到有EGFR的結合。
我不能否認此突變,也許反而造成A與EGFR的結合,但從另一個角度思考,是否因為A與
EGFR結合作用的反應相當快速,因此很難從wild type的A直接看到與EGFR的結合。若真是
如此,還有什麼其他的法法可以解決我的疑問呢?
我目前的想法是,第一,我不用突變的方式來抑制A的活性,因為這樣也許會使其結構產
生改變,我改用hydroxylase inhibitor來處理細胞,將兩者結合之後,抑制接下來的
hydroxylation。第二,直接做Mass spectrometry,偵測EGFR是否被hydroxylation。
如果有版友有類似的實驗經驗,希望可以給我一些意見,謝謝大家!!
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