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[求救] 有關GC rich的PCR

看板Biotech (生命科學)作者 (我和你走散了。)時間10年前 (2015/02/01 13:02), 10年前編輯推噓2(2推 0噓 6→)
留言8則, 3人參與, 最新討論串1/1
實驗中一直遇到某基因處理藥物後的表現無法有一致性 曾經做過幾次預期的結果 卻近幾次都做不出這些結果 曾經懷疑幾個原因 目前覺得可能跟GC rich有關 之前也是有p過其他GC rich的片段 大致都是沒有GC rich buffer就完全p不出來 加了GC rich buffer就p得出來 而我現在遇到這個某基因 則是有時候p得出來有時候p不出來(在都沒有加GC rich buffer時) 想詢問GC rich片段會有這樣的情況嗎 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.4.203 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1422766957.A.2C8.html
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02/01 18:11, , 1F
是不是GC rich並不是二分切半,而是一個比例
02/01 18:11, 1F
這個我說明一下 先前是在做這段基因promoter片段時 意外發現他的promoter部分GC比例很高 當時也有回來看CDS的部分 那時候覺得可能CDS部分GC比例不高 就沒有懷疑GC rich原因 現在因為一直做不出一致性(甚至基因表現一下有一下沒有) 又回來懷疑是GC rich原因 而且算了一下promoter和CDS的GC比例差不多 所以覺得是不是GC rich
推
02/01 18:55, , 2F
要測表現的話應該可以挑其他片段吧, 避開GC rich region
02/01 18:55, 2F
因為CDS不長 所以避不大開T_T 目前是好奇如果PCR遇到GC比例較高的片段 GC rich buffer的有無 對於PCR結果是全有全無 還是機率問題呢 謝謝:) ※ 編輯: jmrla (140.112.4.203), 02/01/2015 19:51:20
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02/01 20:48, , 3F
這麼說好了,假設80%是rich,50%是一般,難道沒有70%,65%嗎？
02/01 20:48, 3F
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02/01 20:48, , 4F
我的意思是GC rich本來就不是二分切半,而是一個相對比例
02/01 20:48, 4F
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02/01 20:51, , 5F
怎會用有無rich這種類別變向,來描述連續變向對PCR的影響呢
02/01 20:51, 5F
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02/01 21:00, , 6F
另外,多數時候你可能只用一般buffer發現有產物就看結果了
02/01 21:00, 6F
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02/01 21:01, , 7F
不會每次都拿GC buffer來比較,當然才容易遇到全有全無
02/01 21:01, 7F
推
02/02 14:05, , 8F
....那就買個GC專用的Taq吧QwQ...
02/02 14:05, 8F
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